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Enregistrement W4391960228 · doi:10.21203/rs.3.rs-3948986/v1

Effective Survival Prediction and Evaluation for Cancer Patients

2024· preprint· en· W4391960228 sur OpenAlexafffund
Mahtab Farrokh, Shi-ang Qi, Neeraj Kumar, Russell Greiner

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Treatments and Mutations
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta Machine Intelligence Institute
Mots-clésCancerOncologyMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: As cancer is the leading global cause of death, an ongoing challenge is predicting an individual’s cancer progression accurately, to facilitate personalized treatment planning. In deploying individual survival prediction models, a pivotal question emerges: Are we striving to compare survival durations between patients (e.g., ‘Who survives longer between patients A and B?’) or are we endeavoring to estimate a specific patient’s survival time (e.g., ‘How long will patient A survive?’), among other scenarios. This paper addresses this fundamental inquiry and conducts a comprehensive evaluation of such predictive models. Materials and methods: We consider 9 common solid tumors (brain, breast, kidney, liver, lung, stomach, prostate, thyroid, and urinary bladder) using data from the Surveillance, Epidemiology, and End Results program. We employ both conventional and advanced machine learning models that predict individualized survival distributions. We consider several different possible goals of a survival prediction model and connect each goal to a specific evaluation metric. We propose modified versions of the mean absolute error tailored to address a query about a patient’s expected survival duration. Results: Our research involved training multiple models on various cancer types and rigorously evaluating those models using the proposed metrics. We demonstrate that a model might be effective for one goal but ineffective for another, and show that we can determine this based on the measure used. Our findings underscore the importance of selecting an appropriate evaluation measure that is aligned with the primary objective of a study. Conclusion: This work highlights the need for evaluation metrics that are relevant to the research objectives and identifies which objective leads to which evaluation metric. This research sets a path for future research that seeks to further refine predictive models for oncological prognostication. Keywords: survival analysis, cancer study, machine learning, effective evaluation

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,015
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,046
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,080

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0150,046
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,514
Écart entre enseignants0,442 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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