Methods for conducting a living evidence profile on mpox: An evidence map of the literature
Notice bibliographique
Résumé
Background: In May of 2022, several cases of mpox were identified in multiple nonendemic countries and on July 23, 2022 the World Health Organization declared mpox a Public Health Emergency of International Concern. During the first six months of the outbreak there was an urgent need to have up-to-date synthesized evidence on mpox to inform public health decision-making. At this point, evidence is changing too quickly for traditional evidence synthesis methods, as systematic reviews were out-of-date before publication. This paper describes the framework developed to manage and maintain a living evidence profile (LEP) to systematically identify, classify and synthesize evidence on a broad range of mpox topics at a rapid pace as the outbreak unfolded. Methods: The LEP framework was based on principles of evidence synthesis, risk assessment, priority epidemiological parameters for infectious disease modeling and consultation with experts. The framework consisted of a systematic search conducted twice weekly; study selection; categorization into pre-determined foci and data extraction; integration and synthesis of evidence; internal peer-review and dissemination to stakeholders. Results: Between April 14 and December 15, 2022, 2287 citations were identified, 687 were primary research studies or surveillance reports on the 2022 mpox outbreak and 496 were included in the final LEP. Each study was mapped to one of 32 foci and evidence was narratively synthesized. From June to December 2022, 23 LEPs were produced (approximately weekly) along with a searchable database of extracted data of the mpox literature. They were disseminated globally to public health researchers and decision-makers to inform public health response efforts. Conclusions: The LEP framework is applicable to other public health emergencies when a rapid synthesis cycle is required because the evidence is evolving quickly. This efficient methodology for creating up-to-date summaries of the current evidence during the first few months of an outbreak or emergency supports public health decision-making and response activities.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,261 | 0,384 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,004 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,009 | 0,013 |
| Bibliométrie | 0,100 | 0,061 |
| Études des sciences et des technologies | 0,005 | 0,006 |
| Communication savante | 0,020 | 0,021 |
| Science ouverte | 0,008 | 0,020 |
| Intégrité de la recherche | 0,007 | 0,007 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,014 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».