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Enregistrement W4392139085 · doi:10.1016/j.gim.2024.101104

CIAO1 and MMS19 deficiency: A lethal neurodegenerative phenotype caused by cytosolic Fe-S cluster protein assembly disorders

2024· article· en· W4392139085 sur OpenAlexafffund
Clara D.M. van Karnebeek, Maja Tarailo‐Graovac, René Leen, Rutger Meinsma, Solenne Correard, Judith Jansen-Meijer, Sergey V. Prykhozhij, Izabella A. Pena, Kevin Ban, Sarah Schock, Vishal Saxena, Mia L. Pras‐Raves, Britt I. Drögemöller, Anita E. Grootemaat, Nicole N. van der Wel, Doreen Dobritzsch, Winfried Roseboom, Bauke V. Schomakers, Yorrick Jaspers, Lida Zoetekouw, Jeroen Roelofsen, Carlos R. Ferreira, Robin van der Lee, Colin J.D. Ross, Jakub Kochan, Rebecca L. McIntyre, Jan B. van Klinken, Michel van Weeghel, Gertjan Kramer, Bernhard Weschke, Philippe Labrune, Michèl A.A.P. Willemsen, Daria Riva, Barbara Garavaglia, John B. Moeschler, James J. Filiano, Marc Ekker, Jason N. Berman, David A. Dyment, Frédéric M. Vaz, Wyeth W. Wasserman, Riekelt H. Houtkooper, André B. P. Kuilenburg

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnergy
ThématiqueMetalloenzymes and iron-sulfur proteins
Établissements canadiensUniversity of ManitobaChildren's Hospital Research Institute of ManitobaUniversity of OttawaAlberta Children's HospitalUniversity of CalgaryBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekStichting MetakidsBC Children's HospitalNational Institutes of HealthChildren's Hospital FoundationRare Disease FoundationUniversity of Ottawa
Mots-clésPhenotypeCytosolCluster (spacecraft)GeneticsMedicineBiologyNeuroscienceBioinformaticsGeneBiochemistryEnzymeComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: The functionality of many cellular proteins depends on cofactors; yet, they have only been implicated in a minority of Mendelian diseases. Here, we describe the first 2 inherited disorders of the cytosolic iron-sulfur protein assembly system. METHODS: Genetic testing via genome sequencing was applied to identify the underlying disease cause in 3 patients with microcephaly, congenital brain malformations, progressive developmental and neurologic impairments, recurrent infections, and a fatal outcome. Studies in patient-derived skin fibroblasts and zebrafish models were performed to investigate the biochemical and cellular consequences. RESULTS: Metabolic analysis showed elevated uracil and thymine levels in body fluids but no pathogenic variants in DPYD, encoding dihydropyrimidine dehydrogenase. Genome sequencing identified compound heterozygosity in 2 patients for missense variants in CIAO1, encoding cytosolic iron-sulfur assembly component 1, and homozygosity for an in-frame 3-nucleotide deletion in MMS19, encoding the MMS19 homolog, cytosolic iron-sulfur assembly component, in the third patient. Profound alterations in the proteome, metabolome, and lipidome were observed in patient-derived fibroblasts. We confirmed the detrimental effect of deficiencies in CIAO1 and MMS19 in zebrafish models. CONCLUSION: A general failure of cytosolic and nuclear iron-sulfur protein maturation caused pleiotropic effects. The critical function of the cytosolic iron-sulfur protein assembly machinery for antiviral host defense may well explain the recurrent severe infections occurring in our patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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