CIAO1 and MMS19 deficiency: A lethal neurodegenerative phenotype caused by cytosolic Fe-S cluster protein assembly disorders
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: The functionality of many cellular proteins depends on cofactors; yet, they have only been implicated in a minority of Mendelian diseases. Here, we describe the first 2 inherited disorders of the cytosolic iron-sulfur protein assembly system. METHODS: Genetic testing via genome sequencing was applied to identify the underlying disease cause in 3 patients with microcephaly, congenital brain malformations, progressive developmental and neurologic impairments, recurrent infections, and a fatal outcome. Studies in patient-derived skin fibroblasts and zebrafish models were performed to investigate the biochemical and cellular consequences. RESULTS: Metabolic analysis showed elevated uracil and thymine levels in body fluids but no pathogenic variants in DPYD, encoding dihydropyrimidine dehydrogenase. Genome sequencing identified compound heterozygosity in 2 patients for missense variants in CIAO1, encoding cytosolic iron-sulfur assembly component 1, and homozygosity for an in-frame 3-nucleotide deletion in MMS19, encoding the MMS19 homolog, cytosolic iron-sulfur assembly component, in the third patient. Profound alterations in the proteome, metabolome, and lipidome were observed in patient-derived fibroblasts. We confirmed the detrimental effect of deficiencies in CIAO1 and MMS19 in zebrafish models. CONCLUSION: A general failure of cytosolic and nuclear iron-sulfur protein maturation caused pleiotropic effects. The critical function of the cytosolic iron-sulfur protein assembly machinery for antiviral host defense may well explain the recurrent severe infections occurring in our patients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».