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Enregistrement W4392162534 · doi:10.3390/biomedicines12030524

Analysis of Primary Chronic Lymphocytic Leukemia Cells’ Signaling Pathways

2024· article· en· W4392162534 sur OpenAlexfundno aff
Josipa Skelin, Maja Matulić, Lidija Milković, Darko Heckel, Jelena Skoko, Kristina Ana Škreb, Biljana Jelić Puškarić, Ika Kardum‐Skelin, Lipa Čičin‐Šain, Delfa Radić-Krišto, Mariastefania Antica

Notice bibliographique

RevueBiomedicines · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Lymphocytic Leukemia Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHrvatska Zaklada za ZnanostUniversity of Toronto
Mots-clésChronic lymphocytic leukemiaclone (Java method)BiologyBone marrowHES1Signal transductionmicroRNACancer researchLeukemiaGeneImmunologybreakpoint cluster regionNotch signaling pathwayCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is a lymphoproliferative disorder characterized by a specific expansion of mature B-cell clones. We hypothesized that the disease has a heterogeneous clinical outcome that depends on the genes and signaling pathways active in the malignant clone of the individual patient. It was found that several signaling pathways are active in CLL, namely, NOTCH1, the Ikaros family genes, BCL2, and NF-κB, all of which contribute to cell survival and the proliferation of the leukemic clone. Therefore, we analyzed primary CLL cells for the gene and protein expression of NOTCH1, DELTEX1, HES1, and AIOLOS in both peripheral blood lymphocytes (PBLs) and the bone marrow (BM) of patients, as well as the expression of BCL2 and miRNAs to see if they correlate with any of these genes. BCL2 and AIOLOS were highly expressed in all CLL samples as previously described, but we show here for the first time that AIOLOS expression was higher in the PBLs than in the BM. On the other hand, NOTCH1 activation was higher in the BM. In addition, miR-15a, miR-181, and miR-146 were decreased and miR-155 had increased expression in most samples. The activation of the NOTCH pathway in vitro increases the susceptibility of primary CLL cells to apoptosis despite high BCL2 expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,775
Score d'incertitude au seuil0,964

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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