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Enregistrement W4392190719 · doi:10.1038/s41467-024-45942-4

The emergence of circadian timekeeping in the intestine

2024· article· en· W4392190719 sur OpenAlexafffund
Kathyani Parasram, Amy Zuccato, Min‐Jeong Shin, Reegan J. Willms, Brian DeVeale, Edan Foley, Phillip Karpowicz

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueCircadian rhythm and melatonin
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Foundation for InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésCircadian rhythmBiologyPhysiologyEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The circadian clock is a molecular timekeeper, present from cyanobacteria to mammals, that coordinates internal physiology with the external environment. The clock has a 24-h period however development proceeds with its own timing, raising the question of how these interact. Using the intestine of Drosophila melanogaster as a model for organ development, we track how and when the circadian clock emerges in specific cell types. We find that the circadian clock begins abruptly in the adult intestine and gradually synchronizes to the environment after intestinal development is complete. This delayed start occurs because individual cells at earlier stages lack the complete circadian clock gene network. As the intestine develops, the circadian clock is first consolidated in intestinal stem cells with changes in Ecdysone and Hnf4 signalling influencing the transcriptional activity of Clk/cyc to drive the expression of tim, Pdp1, and vri. In the mature intestine, stem cell lineage commitment transiently disrupts clock activity in differentiating progeny, mirroring early developmental clock-less transitions. Our data show that clock function and differentiation are incompatible and provide a paradigm for studying circadian clocks in development and stem cell lineages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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