Sex- versus apomixis-specific polymorphisms in the 5′UTR of APOLLO from Boechera shift gene expression from somatic to reproductive tissues in Arabidopsis
Notice bibliographique
Résumé
Introduction Among candidate genes underlying the control components of apomixis, APOLLO is known for its strong linkage to apomeiosis in the genus Boechera . The gene has “apo alleles,” which are characterized by a set of linked apomixis-specific polymorphisms, and “sex alleles.” All apomictic Boechera genotypes are heterozygous for the apo/sex alleles, whereas all sexual genotypes are homozygous for sex alleles. Methods In this study, native and synthetic APOLLO promoters were characterized by detecting the expression level of the β-glucuronidase (GUS) gene in Arabidopsis . Results Comparing various flower developmental stages in transgenic lines containing different constructs with 2-kb native transgenic lines revealed that changes to the APOLLO promoter causes shifts in tissue and developmental stage specificity of GUS expression. Importantly, several apomixis-specific polymorphisms in the 5′UTR change the timing and location of GUS activity from somatic to reproductive tissues. Discussion These synthetic data simulate a plausible evolutionary process, whereby apomixis-specific gene activity can be achieved.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».