MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4392351869 · doi:10.1002/nbm.5121

Sampling pattern discrepancy in the application of compressed sensing hyperpolarized xenon‐129 lung MRI

2024· article· en· W4392351869 sur OpenAlexaff
Mitra Tavakkoli, Sarah Svenningsen, Yonni Friedlander, Norman B. Konyer, Parameswaran Nair, Michael D. Noseworthy

Notice bibliographique

RevueNMR in Biomedicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueAtomic and Subatomic Physics Research
Établissements canadiensMcMaster UniversitySt. Joseph’s Healthcare Hamilton
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésUndersamplingCompressed sensingSampling (signal processing)Computer sciencePattern recognition (psychology)Nuclear medicineMathematicsAlgorithmArtificial intelligenceMedicineComputer visionFilter (signal processing)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Although hyperpolarized (HP) 129 Xe ventilation MRI can be carried out within a breath hold, it is still challenging for many sick patients. Compressed sensing (CS) is a viable alternative to accelerate this approach. However, undersampled images with identical sampling ratios differ from one another. Twenty subjects ( n = 10 healthy and n = 10 patients with asthma) were scanned using a GE MR750 3 T scanner, acquiring fully sampled 2D multi‐slice HP 129 Xe lung ventilation images (10 s breath hold, 128 × 80 (FE × PE—frequency encoding × phase encoding) and 16 slices). Using fully sampled data, 500 variable‐density Cartesian random undersampling patterns were generated, each at eight different sampling ratios from 10% to 80%. The parallel imaging and compressed sensing (PICS) command from BART was employed to reconstruct undersampled data. The signal to noise ratio (SNR), structural similarity index measurement (SSIM) and sidelobe to peak ratio of each were subsequently compared. There was a high degree of variation in both SNR and SSIM results from each of the 500 masks of each sampling rate. As the undersampling increases, there is more variation in the quantifying metrics, for both healthy and asthmatic individuals. Our study shows that random undersampling poses a significant challenge when applied at sampling ratios less than 60%, despite fulfilling CS's incoherency criteria. Such low sampling ratios will result in a large variety of undersampling patterns. Therefore, skipped segments of k ‐space cannot be allowed to happen randomly at low sampling rates. By optimizing the sampling pattern, CS will reach its full potential and be able to be applied to a highly undersampled 129 Xe lung dataset.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,967
Score d'incertitude au seuil0,340

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,320 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNMR in BiomedicineMême sujetAtomic and Subatomic Physics ResearchTravaux en français237 207