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Enregistrement W4392375846 · doi:10.1093/jtm/taae040

Wastewater-based epidemiological surveillance of SARS-CoV-2 new variants BA.2.86 and offspring JN.1 in South and Southeast Asia

2024· article· en· W4392375846 sur OpenAlexaff
Dhammika Leshan Wannigama, Mohan Amarasiri, Phatthranit Phattharapornjaroen, Cameron Hurst, Charin Modchang, Sudarat Chadsuthi, Suparinthon Anupong, Kazuhiko Miyanaga, Longzhu Cui, W. K. C. P. Werawatte, Seyed Mohammad Ali Hosseini Rad, Stefan Fernandez, Angkana T. Huang, Porames Vatanaprasan, Thammakorn Saethang, Sirirat Luk-in, Robin James Storer, Puey Ounjai, Ratana Tacharoenmuang, Naveen Kumar Devanga Ragupathi, Phitsanuruk Kanthawee, Bernadina Cynthia, John Jefferson V. Besa, Asada Leelahavanichkul, Talerngsak Kanjanabuch, Paul G. Higgins, Asuka Nanbo, Anthony Kicic, Andrew C. Singer, Tanittha Chatsuwan, Sam Trowsdale, Takashi Furukawa, Kazunari Sei, Daisuke Sano, Hitoshi Ishikawa, Kenji Shibuya, Aisha Khatib, Shuichi Abe, Parichart Hongsing

Notice bibliographique

RevueJournal of Travel Medicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCentre of Excellence in Mathematics, Mahidol UniversityChulalongkorn UniversityUniversity of Western Australia
Mots-clésMedicineSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)EpidemiologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)VirologySoutheast asia2019-20 coronavirus outbreakCoronavirus InfectionsEnvironmental healthVeterinary medicineInternal medicineInfectious disease (medical specialty)Ancient historyOutbreakDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Discover the shifting landscape of SARS-CoV-2 variants from October to December 2023, with JN.1 dominating South and Southeast Asia wastewater samples, increasing from <10% to >90%. Experience the dynamic evolution of viral strains in this period.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,618
Score d'incertitude au seuil0,531

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,086
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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