MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4392376195 · doi:10.1158/1538-7445.brain23-b044

Abstract B044: Elongation control of mRNA translation drives Group 3 medulloblastoma adaptation to nutrient deprivation

2024· article· en· W4392376195 sur OpenAlexaff
Alberto Delaidelli, Fares Burwag, Jessica Oliveira de Santis, Betty Yao, Haifeng Zhang, Yue Z. Huang, Gian Luca Negri, Christopher Hughes, Gabriel Leprivier, Poul H. Sorensen

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCircular RNAs in diseases
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranslation (biology)MedulloblastomaMessenger RNAAdaptation (eye)BiologyInternal medicineMedicineCancer researchNeuroscienceGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Group 3 affiliation and MYC genetic amplification are associated with poor life expectancy and substantial morbidity in children suffering from medulloblastoma (MB). The high metabolic demand induced by MYC-driven transformation sensitizes MYC-overexpressing MB to cell death under conditions of nutrient deprivation (ND). Additionally, MYC-driven transformation is known to promote mitochondrial oxidative phosphorylation (OXPHOS). We previously reported that eukaryotic Elongation Factor Kinase 2 (eEF2K), the master regulator of mRNA translation elongation, promotes survival of MYC-overexpressing tumors under ND. Interestingly, eEF2K is overexpressed in MYC-driven MB and our preliminary proteomics data highlight large-scale alterations in OXPHOS components affecting eEF2K deficient MB cells. We therefore hypothesized that eEF2K activity is required for the selective translation of mRNAs needed for efficient OXPHOS, and for the progression of MYC-driven MB. METHODS: Multiplexed enhanced Protein Dynamic Mass Spectrometry performed in eEF2K knockdown MYC-overexpressing D425 MB cells to identify mRNAs selectively translated upon eEF2K activation. Time course experiments under ND were conducted in eEF2K knockout (KO) D425 cells to assess the presence of electron transport chain (ETC) complexes I-IV in their native state (via BN-PAGE), as well as transcript expression of individual ETC complex components (by qPCR). The effects of eEF2K inactivation on oxygen consumption, metabolic fluxes and mitochondrial membrane potential were studied with Seahorse technology and JC1/TMRE staining. The viability of eEF2K KO D425 cells was assessed by Incucyte system. Finally, MB orthotopic xenograft mouse models were used to confirm in vitro observations. RESULTS: Multiple (9 out of 10 detected) components of the mitochondrial OXPHOS pathway are selectively translated upon eEF2K activation. Inactivation of eEF2K by genetic KO leads to the disassembly of ETC complexes I-IV without affecting mRNA levels of their respective components. Consistently, eEF2K KO MB cells display decreased mitochondrial membrane potential and ~20% increased proton leak through the mitochondrial membrane. In addition, eEF2K inactivation results in increased D425 cell death under ND and doubles survival of MB bearing mice fed with calorie restricted diets (p<0.05). CONCLUSION: Control of mRNA translation elongation by eEF2K is critical for mitochondrial ETC complex assembly and efficient OXPHOS in MYC-overexpressing MB, likely representing an adaptive response by which MYC-driven MB cells cope with acute metabolic stress. Future therapeutic studies will aim to combine eEF2K inhibition with caloric restriction mimetic drugs as eEF2K activity appears critical under metabolic stress conditions. Citation Format: Alberto Delaidelli, Fares Burwag, Jessica Oliveira de Santis, Betty Yao, Haifeng Zhang, Yue Zhou Huang, Gian Luca Negri, Christopher Hughes, Gabriel Leprivier, Poul Sorensen. Elongation control of mRNA translation drives Group 3 medulloblastoma adaptation to nutrient deprivation [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on Brain Cancer; 2023 Oct 19-22; Minneapolis, Minnesota. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(5 Suppl_1):Abstract nr B044.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,370

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,366
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer ResearchMême sujetCircular RNAs in diseasesTravaux en français237 207