MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4392388261 · doi:10.1038/s41525-024-00398-9

Bi-allelic variants in CELSR3 are implicated in central nervous system and urinary tract anomalies

2024· article· en· W4392388261 sur OpenAlexaff
Jil D. Stegmann, Jeshurun C. Kalanithy, Gabriel C. Dworschak, Nina Ishorst, Enrico Mingardo, Filipa M. Lopes, Yee Mang Ho, Phillip Grote, Tobias Lindenberg, Öznur Yılmaz, Khadija Channab, Steve Seltzsam, Shirlee Shril, Friedhelm Hildebrandt, Felix Boschann, A. Heinen, Angad Jolly, Katherine Myers, Kim L. McBride, Mir Reza Bekheirnia, Nasim Bekheirnia, Marcello Scala, Manuela Morleo, Vincenzo Nigro, Annalaura Torella, Michele Pinelli, Valeria Capra, Andrea Accogli, Silvia Maitz, Alice Spano, Rory J. Olson, Eric W. Klee, Brendan C. Lanpher, Se Song Jang, Jong‐Hee Chae, Philipp Steinbauer, Dietmar Rieder, Andreas Janecke, Julia Vodopiutz, Ida Vogel, Jenny Blechingberg, Jennifer L. Cohen, Kacie Riley, Victoria Klee, Laurence E. Walsh, Matthias Begemann, Miriam Elbracht, Thomas Eggermann, Arzu Stoppe, Kyra E. Stuurman, Marjon van Slegtenhorst, Tahsin Stefan Barakat, Maureen Mulhern, Tristan T. Sands, Cheryl Cytrynbaum, Rosanna Weksberg, Federica Isidori, Tommaso Pippucci, Giulia Severi, Francesca Montanari, Michael C. Kruer, Somayeh Bakhtiari, Hossein Darvish, Heiko Reutter, Gregor Hagelueken, Matthias Geyer, Adrian S. Woolf, Jennifer E. Posey, James R. Lupski, Benjamin Odermatt, Alina C. Hilger

Notice bibliographique

Revuenpj Genomic Medicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAmino Acid Enzymes and Metabolism
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoMcGill University
Organismes subventionnairesLeibniz-GemeinschaftMedical Research CouncilFriedrich-Alexander-Universität Erlangen-NürnbergRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnNational Human Genome Research InstituteNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekElse Kröner-Fresenius-StiftungNovo Nordisk FondenNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesZonMwDeutsche ForschungsgemeinschaftNational Institutes of HealthYale UniversityNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute for Health and Care ResearchMuscular Dystrophy Association
Mots-clésUrinary systemAlleleCentral nervous systemBiologyGeneticsMedicineNeuroscienceGeneAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CELSR3 codes for a planar cell polarity protein. We describe twelve affected individuals from eleven independent families with bi-allelic variants in CELSR3. Affected individuals presented with an overlapping phenotypic spectrum comprising central nervous system (CNS) anomalies (7/12), combined CNS anomalies and congenital anomalies of the kidneys and urinary tract (CAKUT) (3/12) and CAKUT only (2/12). Computational simulation of the 3D protein structure suggests the position of the identified variants to be implicated in penetrance and phenotype expression. CELSR3 immunolocalization in human embryonic urinary tract and transient suppression and rescue experiments of Celsr3 in fluorescent zebrafish reporter lines further support an embryonic role of CELSR3 in CNS and urinary tract formation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,956
Score d'incertitude au seuil0,597

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuenpj Genomic MedicineMême sujetAmino Acid Enzymes and MetabolismTravaux en français237 207