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Enregistrement W4392448301 · doi:10.1101/2024.03.05.24303395

Epidemiology, clinical characteristics, and transmission patterns of a novel Mpox (Monkeypox) outbreak in eastern Democratic Republic of the Congo (DRC): <i>an observational, cross-sectional cohort study</i>

2024· preprint· en· W4392448301 sur OpenAlexafffund
Leandre Murhula Masirika, Jean Claude Udahemuka, Pacifique Ndishimye, Gustavo Sganzerla Martinez, Patricia Kelvin, Maliyamungu Bubala Nadine, Bilembo Kitwanda Steeven, Franklin Kumbana Mweshi, Léandre Mutimbwa Mambo, Bas B. Oude Munnink, Justin Bengehya Mbiribindi, Freddy Belesi Siangoli, Trudie Lang, Jean Malekani, Frank M. Aarestrup, Marion Koopmans, Leonard Schuele, Jean Pierre Musabvimana, Brigitte Umutoni, Ali Toloue Ostadgavahi, Benjamin Hewins, Mansi Dutt, Anuj Kumar, Alyson A. Kelvin, Jean-Paul Kabemba Lukusa, Christian Gortázar, David J. Kelvin, Luis Flores

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePoxvirus research and outbreaks
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanIzaak Walton Killam Health CentreDalhousie University
Organismes subventionnairesEuropean and Developing Countries Clinical Trials PartnershipResearch Nova ScotiaCanadian Institutes of Health ResearchDalhousie UniversityConservation Action Research NetworkDalhousie Medical Research Foundation
Mots-clésOutbreakEpidemiologyMedicineTransmission (telecommunications)CohortMonkeypoxCohort studyCross-sectional studyObservational studyDemographyPediatricsVirologyInternal medicinePathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary (abstract) Background In August 2023, an outbreak of mpox was reported in the eastern part, South Kivu Province, of Democratic Republic of the Congo. In this study, we aimed to investigate the origin of this outbreak and to assess how monkeypox virus spread among humans in the city of Kamituga. Methods We performed an observational cohort study by recruiting hospitalized patients with mpox-like symptoms. Furthermore, we compared structured, de-identified case report forms and interviews were conducted to determine the possible origins and modes of transmission of the mpox outbreak. We describe the clinical characteristics and epidemiology observed in reported infections. Findings During the study period (24 September 2023 to 29 January 2024), 164 patients were admitted to the Kamituga hospital, 51 individuals were enrolled in the study and interviewed, and 37 (73%) of 51 individuals received a molecularly confirmed mpox diagnosis. The median age for males was 24 years (IQR 18-30; range 14-36) and 19 years for females (IQR 17-21; range 1-59). The cohort was comprised of 47 (92%) of 51 individuals who identified as heterosexual, and two (4%) of 51 as bisexual, with 31 (61%) of 51 individuals sexually active with more than one partner within the last six months. The direct transmission routes are unknown; however, it is expected that the majority of infections were transmitted via occupational exposures. Out of the 51 individuals, 24 (47%) were professional sex workers (PSWs), while five (10%) were gold miners, 6 (12%) were students, and four (8%) were farmers; the remaining individual occupations were unknown. The most common symptoms associated with clinical mpox diagnosis were fever, which was described in 38 (75%) of 51 individuals, and rash, which was described in 45 (88%) of 51 individuals. Among those with a rash, 21 (41%) of 51 individuals experienced oral lesions, and 32 (63%) of 51 presented anogenital lesions. Mpox viral DNA was detected by qPCR from vaginal, penile, and oral swabs in 37 (73%) of 51 enrolled individuals. Two deaths were reported. Interpretation In this observational cohort study, mpox virus infection caused symptoms in a wide age range of participants with most cases presenting in sexually active individuals. Symptoms included fever, cough, lymphadenopathy, sore throat, chills, headache, back pain, muscle pain, vomiting, nausea, conjunctivitis, and rash (oral and anogenital). Heterosexual partners dominated human-to-human contact transmission suggesting that heterosexual close contact is the main form of transmission in this outbreak. Furthermore, Professional Sex Workers (PSWs) were the dominant occupation among infected individuals, indicating that PSWs and clients may be at higher risk for developing mpox virus infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,168
Tête enseignante GPT0,406
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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