MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4392467205 · doi:10.1101/2024.03.03.583214

The flavohemoglobin Yhb1 is a new interacting partner of the heme transporter Str3

2024· preprint· en· W4392467205 sur OpenAlex
Florie Lo Ying Ping, Tobias Vahsen, Ariane Brault, Raphaël Néré, Simon Labbé

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHemoglobin structure and function
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésTransporterHemeBusinessComputer scienceChemistryBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Nitric oxide (NO) is a gaseous molecule that induces nitrosative stress, which can jeopardize cell viability. Yeasts have evolved diverse detoxification mechanisms to effectively counteract NO-mediated toxicity. One mechanism relies on the flavohemoglobin Yhb1, whereas a second one requires the S-nitrosoglutathione reductase Fmd2. However, in this study, we eliminate any contribution from Fmd2 by using strains deleted for this gene. To investigate heme-dependent activation of Yhb1 in response to NO, we use hem1Δ -derivative Schizosaccharomyces pombe strains lacking the initial enzyme in heme biosynthesis, forcing cells to assimilate heme from external sources. Under these conditions, yhb1 + mRNA levels are repressed in the presence of iron through a mechanism involving the GATA-type transcriptional repressor Fep1. In contrast, when iron levels are low, the transcription of yhb1 + is derepressed and further induced in the presence of the NO donor DETANONOate. Cells lacking Yhb1 or expressing inactive forms of Yhb1 fail to grow in a hemin-dependent manner when exposed to DETANONOate. Similarly, loss of function of the heme transporter Str3 phenocopies the effects of Yhb1 disruption by causing hypersensitivity to DETANONOate under hemin-dependent culture conditions. Coimmunoprecipitation and bimolecular fluorescence complementation assays demonstrate the interaction between Yhb1 and the heme transporter Str3. Collectively, our findings unveil a novel pathway for activating Yhb1, fortifying yeast cells against nitrosative stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,143
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle