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Enregistrement W4392488667 · doi:10.5194/essd-16-1177-2024

PANABIO: a point-referenced PAN-Arctic data collection of benthic BIOtas

2024· article· en· W4392488667 sur OpenAlexaboutno aff
Dieter Piepenburg, Thomas Brey, Katharina Teschke, Jennifer Dannheim, Paul Kloss, Marianne Rehage, Miriam L. S. Hansen, Casper Kraan

Notice bibliographique

RevueEarth system science data · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesH2020 Marie Skłodowska-Curie ActionsBundesanstalt für Landwirtschaft und ErnährungDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésBenthic zoneThe arcticArcticPoint (geometry)OceanographyEnvironmental scienceGeologyMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract. Profound environmental changes, such as drastic sea-ice decline, leave large-scale ecological footprints on the distribution and composition of marine biota in the Arctic. Currently, the impact of such stressors is not sufficiently understood due to the lack of pan-Arctic data that allow for estimating ecological baselines as well as modelling current and forecast potential changes in benthic biodiversity and ecosystem functioning. Here, we introduce the PAN-Arctic data collection of benthic BIOtas (PANABIO) and discuss its timeliness, potential, and details of its further development. The data collection contains individual datasets with records (presence, counts, abundance, or biomass) of benthic fauna, usually at genus level or species level, which were identified in field samples obtained at point-referenced locations (stations) by means of grabs, towed gear, or seabed imaging. The data cover the entire pan-Arctic realm, i.e. the central Arctic Ocean, Chukchi Sea, East Siberian Sea, Laptev Sea, Kara Sea, Barents Sea (including the White Sea), Svalbard waters, Greenland Sea, Norwegian Sea, Canadian Archipelago, Beaufort Sea, and Bering Sea as well as some adjacent sub-Arctic regions (Sea of Japan, Gulf of Okhotsk). Currently (as of 14 December 2023), PANABIO includes 27 datasets with a total of 126 388 records of 2978 taxa collected from 11 555 samples taken at 10 596 stations during 1095 cruises between 1800 and 2014. These numbers will increase with more data becoming available over time through contributions from PANABIO users. The data collection is available in a PostgreSQL-based data warehouse that can be accessed and queried through an open-access front-end web service at https://critterbase.awi.de/panabio (last access: 27 February 2024). A snapshot of the current data collection and its 27 individual datasets is also available from the data publisher PANGAEA (https://doi.org/10.1594/PANGAEA.963640, Piepenburg et al., 2023).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,157
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,002
Science ouverte0,0040,007
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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