Diving dinosaurs? Caveats on the use of bone compactness and pFDA for inferring lifestyle
Notice bibliographique
Résumé
The lifestyle of spinosaurid dinosaurs has been a topic of lively debate ever since the unveiling of important new skeletal parts for Spinosaurus aegyptiacus in 2014 and 2020. Disparate lifestyles for this taxon have been proposed in the literature; some have argued that it was semiaquatic to varying degrees, hunting fish from the margins of water bodies, or perhaps while wading or swimming on the surface; others suggest that it was a fully aquatic underwater pursuit predator. The various proposals are based on equally disparate lines of evidence. A recent study by Fabbri and coworkers sought to resolve this matter by applying the statistical method of phylogenetic flexible discriminant analysis to femur and rib bone diameters and a bone microanatomy metric called global bone compactness. From their statistical analyses of datasets based on a wide range of extant and extinct taxa, they concluded that two spinosaurid dinosaurs (S. aegyptiacus, Baryonyx walkeri) were fully submerged "subaqueous foragers," whereas a third spinosaurid (Suchomimus tenerensis) remained a terrestrial predator. We performed a thorough reexamination of the datasets, analyses, and methodological assumptions on which those conclusions were based, which reveals substantial problems in each of these areas. In the datasets of exemplar taxa, we found unsupported categorization of taxon lifestyle, inconsistent inclusion and exclusion of taxa, and inappropriate choice of taxa and independent variables. We also explored the effects of uncontrolled sources of variation in estimates of bone compactness that arise from biological factors and measurement error. We found that the ability to draw quantitative conclusions is limited when taxa are represented by single data points with potentially large intrinsic variability. The results of our analysis of the statistical method show that it has low accuracy when applied to these datasets and that the data distributions do not meet fundamental assumptions of the method. These findings not only invalidate the conclusions of the particular analysis of Fabbri et al. but also have important implications for future quantitative uses of bone compactness and discriminant analysis in paleontology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».