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Enregistrement W4392507815 · doi:10.1177/01926233241230553

Guide for Combining Primary Tumors for Statistical Analysis in Rodent Carcinogenicity Studies

2024· article· en· W4392507815 sur OpenAlexaff
Charlotte M. Keenan, Muthafar Al-Haddawi, Jean-Guy Bienvenu, Alys Bradley, Paul C. Brown, Hepei Chen, Karyn Colman, Michael R. Elwell, Nicholas T. Gatto, Dawn G. Goodman, Binod Jacob, Lynda Lanning, LuAnn McKinney, Erin Muhlbradt, Rick Perry, Alessandro Piaia, Daniel Potenta, Karen Regan, Benjamin Sefing, Michael S. Thibodeau, Erin Tibbs-Slone, Jochen Woicke, Craig Zwickl

Notice bibliographique

RevueToxicologic Pathology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunotoxicology and immune responses
Établissements canadiensCanadian Nuclear Laboratories
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTerminologyHarmonizationFood and drug administrationComputer scienceMedicineMedical physicsDocumentationStatistical analysisData sciencePharmacologyStatistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Tumor Combination Guide was created at the request of the U. S. Food and Drug Administration (FDA) by a Working Group of biopharmaceutical experts from international societies of toxicologic pathology, the Food and Drug Administration (FDA), and members of the Standard for Exchange of Nonclinical Data (SEND) initiative, to assist pharmacology/toxicology reviewers and biostatisticians in statistical analysis of nonclinical tumor data. The guide will also be useful to study and peer review pathologists in interpreting the tumor data. This guide provides a higher-level hierarchy of tumor types or categories correlating the tumor names from the International Harmonization of Nomenclature and Diagnostic Criteria (INHAND) publications with those available in the NEOPLASM controlled terminology (CT) code list in SEND. The version of CT used in a study should be referenced in the nonclinical study data reviewer's guide (SDRG) (section 3.1) of electronic submissions to the FDA. The tumor combination guide instructions and examples are in a tabular format to make informed decisions for combining tumor data for statistical analysis. The strategy for combining tumor types for statistical analysis is based on scientific criteria gleaned from the current scientific literature; as SEND and INHAND terminology and information evolve, this guide will be updated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,049
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,095
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,077
Score d'incertitude au seuil0,257

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0490,095
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0080,005
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0040,002
Intégrité de la recherche0,0020,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0770,051

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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