MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4392542502 · doi:10.1101/2024.03.06.583796

Nano-scale viscometry reveals an inherent mucus defect in cystic fibrosis

2024· preprint· en· W4392542502 sur OpenAlexafffund
Olga Ponomarchuk, Francis Boudreault, Ignacy Gryczyński, S. M. Dzyuba, Rafał Fudala, Zygmunt Gryczyński, John P. Hanrahan, Ryszard Grygorczyk

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesUniversité de MontréalCystic Fibrosis CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésMucusMucinSecretionCystic fibrosisChemistryBiophysicsMacromoleculeCell biologyBiochemistryBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Abnormally viscous and thick mucus is a hallmark of cystic fibrosis (CF). How the genetic defect causes abnormal mucus in CF remains unanswered and a question of paramount interest. Mucus is produced by hydration of gel-forming mucin macromolecules that are stored in secretory granules prior to release. Current understanding of mucin/mucus structure before and after secretion remains limited and contradictory models exist. Here we used a molecular viscometer and fluorescence lifetime imaging of primary epithelial cells (Normal and CF) to measure nanometer-scale viscosity. We found significantly elevated intraluminal nanoviscosity in a population of CF mucin granules, indicating an intrinsic, pre-secretory, mucin defect. Validation experiments showed that high nanoviscosity in cellular environments is mainly due to the low mobility of water that hydrates macromolecules. Nanoviscosity influences protein conformational dynamics and function. Its elevation along the protein secretory pathway indicates molecular overcrowding and is expected to alter mucin’s post-translational processing, hydration, and mucus rheology after release. The nanoviscosity of extracellular CF mucus was elevated compared to non-CF mucus. Remarkably, it was higher after secretion than in granules, which suggests mucins have a weakly-ordered state in granules and adopt a highly-ordered, nematic crystalline structure extracellularly. This challenges the classical view of mucus as a porous agarose-like gel and suggests an alternative model for mucin organization before and after secretion. Our study also suggests that endoplasmic reticulum stress due to molecular overcrowding contributes to mucus pathogenesis in CF cells. It encourages the development of therapeutics that target pre-secretory mechanisms in CF and other muco-obstructive lung diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetCystic Fibrosis Research Advances→Travaux en français237 207→