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Enregistrement W4392563696 · doi:10.1016/j.gim.2024.101119

A recurrent missense variant in the E3 ubiquitin ligase substrate recognition subunit FEM1B causes a rare syndromic neurodevelopmental disorder

2024· article· en· W4392563696 sur OpenAlexaff
François Lecoquierre, A. Mattijs Punt, Frédéric Ebstein, Ilse Wallaard, Rob F. M. Verhagen, Maja Studencka‐Turski, Yannis Duffourd, Sébastien Moutton, Frédédic Tran Mau-Them, Christophe Philippe, John Dean, Stephen Tennant, Alice S. Brooks, Marjon A. van Slegtenhorst, Julie A. Jurgens, Brenda J. Barry, Wai‐Man Chan, Eleina England, Mayra Martinez Ojeda, Elizabeth C. Engle, Caroline D. Robson, Michelle M. Morrow, A. Micheil Innes, Ryan E. Lamont, Matthea R. Sanderson, Elke Krüger, Christel Thauvin, Ben Distel, Laurence Faivre, Ype Elgersma, Antonio Vitobello

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of AlbertaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Eye InstituteNational Human Genome Research InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteEuropean CommissionBroad InstituteNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismDeutsche ForschungsgemeinschaftEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésUbiquitin ligaseMissense mutationProtein subunitNeurodevelopmental disorderUbiquitinPhenotypeBiologyMedicineGeneticsCell biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Fem1 homolog B (FEM1B) acts as a substrate recognition subunit for ubiquitin ligase complexes belonging to the CULLIN 2-based E3 family. Several biological functions have been proposed for FEM1B, including a structurally resolved function as a sensor for redox cell status by controlling mitochondrial activity, but its implication in human disease remains elusive. METHODS: To understand the involvement of FEM1B in human disease, we made use of Matchmaker exchange platforms to identify individuals with de novo variants in FEM1B and performed their clinical evaluation. We performed functional validation using primary neuronal cultures and in utero electroporation assays, as well as experiments on patient's cells. RESULTS: variant but not FEM1B wild-type protein, during mouse brain development, resulted in delayed neuronal migration of the target cells. In addition, the individuals' cells exhibited signs of oxidative stress and induction of type I interferon signaling. CONCLUSION: Overall, our data indicate that p.(Arg126Gln) induces aberrant FEM1B activation, resulting in a gain-of-function mechanism associated with a severe syndromic developmental disorder in humans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,742
Score d'incertitude au seuil0,796

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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