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Enregistrement W4392586024 · doi:10.5194/egusphere-egu24-4242

Studying pathogen attenuation and transport in freshwater systems using novel surrogate technology

2024· preprint· en· W4392586024 sur OpenAlexaff
Liping Pang, Sujani Ariyadasa, Travis Issler, Beth Robson, Richard Sutton, Susan Lin, Panan Sitthirit, Elmar J. Prenner, Craig Billington

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFecal contamination and water quality
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAttenuationPathogenComputer scienceEngineeringPhysicsBiologyMicrobiologyOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

By mimicking the physicochemical properties of important waterborne pathogens, we believe that synthetic particles can be used to predict water contamination risks in freshwaters and help to design improved water treatment systems and water-supply bore protections.We have developed two generations of synthetic pathogen surrogates for water quality applications. The first-generation was based on biomolecule-modifications of commercially available microspheres and nanoparticles to produce surrogates for the pathogens Cryptosporidium, rotavirus and adenovirus. The second-generation is based on biomolecule-modifications of microparticles and nanoparticles that we have made from food-grade natural biopolymers to produce surrogates for the pathogens Legionella, Cryptosporidium and rotavirus.The surrogates have closely mimicked the physicochemical properties (e.g., size, shape, surface charge, hydrophobicity) of the target pathogens. Experiments conducted have validated surrogates’ performance against the actual pathogens in different systems; the surrogates displayed the same order of magnitude removal as the target pathogens in different experimental conditions.The first-generation Cryptosporidium surrogates were used in pilot-scale studies to evaluate the efficacies of protozoan removal by drinking-water filtration systems commonly used in New Zealand under typical operating conditions. These included testing rapid sand filtration systems at a water treatment plant in collaboration with the Invercargill City Council and domestic point-of-use water filters in a domestic plumbing test rig. The experimental findings were incorporated into quantitative microbial risk assessments. Health-risk scenarios were identified and recommendations for improving water treatment performance were communicated to end-users. Our experimental results have also highlighted that turbidity, a key test of water clarity and a proxy for water quality used by water plant operators, may not be a reliable indicator of protozoan removal.Recently, we have advanced our pathogen surrogate technology by producing and testing a second-generation of surrogates that are more compatible with use in natural water systems. These surrogates, made from food-grade natural biopolymers, can be applied in operational water treatment systems and eco-sensitive freshwater environments. Our preliminary studies suggest that these new pathogen surrogates show great promise as new tools for water applications. We will conduct further validations.We can label the surrogates with unique synthetic DNA sequences for tracking and detection purposes. Degradation of the surrogates’ DNA was found to mimic pathogen’s DNA degradation to some degree. The DNA-tagged surrogates, even at very low concentrations, can be analysed sensitively and rapidly using qPCR. Working with ECAN and Waikato Regional Council, we have validated DNA encapsulated biopolymer particles (as pollution source tracers) in surface water, groundwater and soils, and they were readily trackable in a surface stream for at least 1 km.The surrogate technology approach has opened a new avenue for assessing pathogen removal and transport in water systems without the risk and expense that accompany work with actual pathogens. The research findings will facilitate improved management systems and engineering approaches to reduce waterborne infection risks and safeguard public health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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