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Enregistrement W4392593037 · doi:10.1002/anie.202402123

Lowering Entropic Barriers in Triplex DNA Switches Facilitating Biomedical Applications at Physiological pH

2024· article· en· W4392593037 sur OpenAlexaff
Yanli Lei, Chuang‐Chuang Li, Xinyue Ji, Haiyan Sun, Xiaowen Liu, Zenghui Mao, Wei‐Ju Chen, Zhihe Qing, Juewen Liu

Notice bibliographique

RevueAngewandte Chemie International Edition · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesScience and Technology Innovative Research Team in Higher Educational Institutions of Hunan ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésTriple helixLinkerDNAChemistryNanotechnologyMolecular switchAllosteric regulationHelix (gastropod)BiophysicsCombinatorial chemistryMaterials scienceMoleculeComputer scienceBiochemistryStereochemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Triplex DNA switches are attractive allosteric tools for engineering smart nanodevices, but their poor triplex‐forming capacity at physiological conditions limited the practical applications. To address this challenge, we proposed a low‐entropy barrier design to facilitate triplex formation by introducing a hairpin duplex linker into the triplex motif, and the resulting triplex switch was termed as CTNS ds . Compared to the conventional clamp‐like triplex switch, CTNS ds increased the triplex‐forming ratio from 30 % to 91 % at pH 7.4 and stabilized the triple‐helix structure in FBS and cell lysate. CTNS ds was also less sensitive to free‐energy disturbances, such as lengthening linkers or mismatches in the triple‐helix stem. The CTNS ds design was utilized to reversibly isolate CTCs from whole blood, achieving high capture efficiencies (>86 %) at pH 7.4 and release efficiencies (>80 %) at pH 8.0. Our approach broadens the potential applications of DNA switches‐based switchable nanodevices, showing great promise in biosensing and biomedicine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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