MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4392598768 · doi:10.5194/egusphere-egu24-3644

Universal microbial reworking of dissolved organic matter along soil gradients

2024· preprint· en· W4392598768 sur OpenAlexaff
Erika C. Freeman, Erik J. S. Emilson, Thorsten Dittmar, Lucas P. P. Braga, Caroline E. Emilson, Tobias Goldhammer, Christine Martineau, Gabriel Singer, Andrew J. Tanentzap

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensTrent UniversityNatural Resources CanadaCanadian Forest Service
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDissolved organic carbonOrganic matterSoil organic matterEnvironmental scienceEnvironmental chemistrySoil scienceEarth scienceChemistrySoil waterEcologyGeologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Soils lose a large amount of carbon annually to freshwaters as dissolved organic matter (DOM), which, if degraded, can undermine climate change mitigation. The degradation state of DOM in aquatic ecosystems can reflect the distance from its source, with DOM increasingly dominated by similar compounds as degradation proceeds. However, the processes underlying the degradation of DOM and its generality across environments are poorly understood. Here we found DOM changed similarly along two soil-aquatic gradients irrespective of environmental conditions. We tracked DOM across soil depths and hillslope positions in forest headwater catchments using ultra-high-resolution mass spectrometry and related its composition to soil microbiomes and physical chemistry. Along both gradients, carbohydrate-like and unsaturated hydrocarbon-like compounds increased in mass, suggestive of microbial reworking of plant material. Most of the variation in the abundance of these compounds (>56%) was related to the expression of genes important for breaking down plant-derived carbohydrates. Our results highlight the value of high-resolution molecular data in understanding global carbon cycles, directly implicate microbial processing in shifting DOM towards universal compounds in soils, and suggest that this process is generalizable across ecosystems and spatiotemporal scales. This consistent degradation process could provide insights for estimating the state of DOM in different environments and inform the management of soil-to-stream carbon losses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même sujetMicrobial Community Ecology and Physiology→Travaux en français237 207→