Universal microbial reworking of dissolved organic matter along soil gradients
Notice bibliographique
Résumé
Soils lose a large amount of carbon annually to freshwaters as dissolved organic matter (DOM), which, if degraded, can undermine climate change mitigation. The degradation state of DOM in aquatic ecosystems can reflect the distance from its source, with DOM increasingly dominated by similar compounds as degradation proceeds. However, the processes underlying the degradation of DOM and its generality across environments are poorly understood. Here we found DOM changed similarly along two soil-aquatic gradients irrespective of environmental conditions. We tracked DOM across soil depths and hillslope positions in forest headwater catchments using ultra-high-resolution mass spectrometry and related its composition to soil microbiomes and physical chemistry. Along both gradients, carbohydrate-like and unsaturated hydrocarbon-like compounds increased in mass, suggestive of microbial reworking of plant material. Most of the variation in the abundance of these compounds (>56%) was related to the expression of genes important for breaking down plant-derived carbohydrates. Our results highlight the value of high-resolution molecular data in understanding global carbon cycles, directly implicate microbial processing in shifting DOM towards universal compounds in soils, and suggest that this process is generalizable across ecosystems and spatiotemporal scales. This consistent degradation process could provide insights for estimating the state of DOM in different environments and inform the management of soil-to-stream carbon losses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».