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Enregistrement W4392601239 · doi:10.5194/egusphere-egu24-6722

Functional and genotypic diversity of pea (Pisum sativum L.) microsymbionts in several geographical sites in Tunisia: Selection of inoculant strains for biofertilizer formulation

2024· preprint· en· W4392601239 sur OpenAlexaff
Amira Hachana, Imen Hemissi, Amir Souissi, Anissa Riahi, Neila Abdi, Manel Bouraoui, Hanen Arfaoui, Imen Cherif, Raoudha Ferjani, B. Sifi

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSativumMicrobial inoculantPisumBiologySelection (genetic algorithm)BiofertilizerBotanyHorticultureInoculation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pea (Pisum sativum L.) is a leguminous plant that is cultivated for its nutritional value and advantageous effects on soil fertility when used as a preceding crop. Its symbiotic nitrogen fixation and phosphorus solubilization properties thanks to the association with rhizospheric bacteria make it crucial component in cereal-based cropping systems. In Tunisia, the upscaling of pea cultivation faces numerous challenges, including low yields attributed to soil fertility depletion and the low abundance or ineffectiveness of specific rhizobia for achieving optimal pea nodulation.The current study aims to assess the diversity and plant growth promoting traits of pea endophytic bacteria in order to select effective inoculant strains. For this purpose, 166 bacterial strains were isolated from root nodules of pea plants, collected from 46 regions in Tunisia. The strains were subjected to thorough in vitro assays, involving morphological, functional, and genetic characterization.The results demonstrated that 153 strains were tested Gram-negative and 13 strains Gram-positive. Among the Gram-negative isolates, 44 strains induced nodule formation on pea plants of the 'Lincoln' variety, but mostly produced low nodule number and biomass and poor plant growth. The assessment of phosphorus solubilization among the whole isolates collection revealed a highly significant difference in the halo diameter formed on Pikovskaya medium and the phosphorus solubilization index. One hundred thirteen isolates were capable of solubilizing inorganic phosphorus.The analysis of functional diversity of pea microsymbionts showed that Rhizobium strains (Oued Bj0.16, BjD, KalAM, MzBrg, Jbn, Morg15, Jed3, Sbit1, and Sb4), that were originated respectively from Beja, Kalaat Andalous, Menzel Bourguiba, Jbeniana, Morneg, Jedaida, Sbitla, and Sbiba sites, presented the highest efficiency in regards of nitrogen fixation. Furthermore, the strain Oued Bj0.16 demonstrated a moderate ability to solubilize phosphorus whereas the strain SoliL stands as the most efficient phosphorus-solubilizing bacteria (PSB). Concerning non-nodulating bacteria, BsM, Mat3L, MzelTM, and Mok4 were identified as a highly efficient PSB. In addition, the Gram-positive strain TebkL, originated from Beja, was identified as the most efficient P-solubilizer. The 16S gene sequencing revealed that pea nodular microsymbionts were attributed to 6 different genera: Rhizobium sp., Rhizobium leguminosarum, Parabulkolderia fungorum, Pantoea sp., Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas baetica, Bacillus subtilis, Paenibacillus polymyxa, and Rhizobium nepotum. The exploration of pea microsymbionts diversity demonstrated extensive functional and genetic variations associated with the isolates origin.In a nutshell, the application of single or mix of these beneficial bacteria as inoculant is an eco-friendly option that provides nitrogen and phosphorus to the crops and gets rid of chemical fertilizer, thereby promoting plant growth and preserving the environment in a Mediterranean context.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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