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Enregistrement W4392606713 · doi:10.1016/j.gimo.2024.101522

P616: Genome-wide Sequencing Ontario (GSO): Insight into Ontario’s rare disease landscape

2024· article· en· W4392606713 sur OpenAlexaffabout
Meredith Gillespie, Robin Z. Hayeems, Christian R. Marshall, Anna Szuto, Caitlin Chisholm, Wendy J. Ungar, James Stavropoulos, Lijia Huang, Viji Venkataramanan, Lynette Lau, Wilson W. L. Sung, Mélanie Beaulieu Bergeron, Ted Higginbotham, Meredith Curtis, Venuja Sriretnakumar, Hassan Zaidi, E. Hitchcock, Audrey Schaffer, Sarah L. Sawyer, Gregory Costain, Roberto Mendoza‐Londono, Martin J. Somerville, Kym M. Boycott, Taila Hartley

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine Open · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensUniversity of TorontoInstitute for Clinical Evaluative SciencesSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRare diseaseDiseaseGenomeGeographyBiologyGeneticsMedicineGeneInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genome-wide sequencing (GWS) has been identified as a key strategy for achieving a timely diagnosis for patients with rare diseases. Prior to April 2021, access to all clinical GWS for Ontarians was facilitated by a Ministry of Health (MOH) out-of-country testing program. While this program provided access to testing not available at clinical laboratories in Canada, it was labor-intensive and did not provide knowledge of diagnostic outcomes from GWS. Establishment of local infrastructure was essential to increase access to GWS, enabling a locally representative knowledge base and a performance measurement system that could guide technical and policy decisions related to the use of GWS over time.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,972
Score d'incertitude au seuil0,206

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,005
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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