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Enregistrement W4392637081 · doi:10.1093/biosci/biae006

Too simple, too complex, or just right? Advantages, challenges, and guidance for indicators of genetic diversity

2024· article· en· W4392637081 sur OpenAlexaff
Sean Hoban, Jessica M. da Silva, Alice C. Hughes, Margaret E. Hunter, Belma Kalamujić Stroil, Linda Laikre, Alicia Mastretta‐Yanes, Katie L. Millette, Ivan Paz‐Vinas, Lucia Ruiz Bustos, Robyn E. Shaw, Cristiano Vernesi, W. Chris Funk, Catherine E. Grueber, Francine Kershaw, Anna J. MacDonald, Mariah H. Meek, Cinnamon Mittan, David O’Brien, Rob Ogden, Gernot Segelbacher

Notice bibliographique

RevueBioScience · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesU.S. Geological SurveyNaturvårdsverketEuropean Cooperation in Science and Technology
Mots-clésConvention on Biological DiversityGenetic diversityDiversity (politics)Conservation geneticsPopulationCredibilityBiodiversityResource (disambiguation)Environmental resource managementBiologyEcologyComputer sciencePolitical scienceGeneticsEconomicsSociologyDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Measuring genetic diversity of wild species using DNA-based data remains resource intensive and time consuming for nearly all species. However, genetic assessments are needed for global conservation commitments, including the Convention on Biological Diversity, and for governments and managers to evaluate conservation progress, as well as prioritizing species and populations to preserve and recover genetic diversity (e.g., via genetic rescue). Recently, indicators were developed for tracking and reporting genetic diversity status and trends for hundreds of species. The indicators quantify two simple proxies of within-population and among-population genetic diversity and adaptive potential: small effective population size (Ne < 500) and the loss of genetically distinct populations. The indicators must balance scientific credibility, practicality, and simplicity. In the present article, we summarize the advantages of these pragmatic indicators, address critiques by scientists for simplifying assumptions and by policymakers for complexity, and propose potential solutions and next steps. We aim to support practitioners putting indicators into policy, action, legislation, and reporting.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,189
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,363
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,189
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1890,363
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0080,006
Études des sciences et des technologies0,0040,026
Communication savante0,0250,024
Science ouverte0,0060,009
Intégrité de la recherche0,0120,018
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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