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Enregistrement W4392641112 · doi:10.7554/elife.92552.3.sa0

eLife assessment: Developmental conversion of thymocyte-attracting cells into self-antigen-displaying cells in embryonic thymus medulla epithelium

2024· peer-review· en· W4392641112 sur OpenAlexaff
Juan Carlos Zúñiga‐Pflücker

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiomedical and Engineering Education
Établissements canadiensSunnybrook Health Science CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEmbryonic stem cellThymocyteMedullaCell biologyEpitheliumBiologyAntigenImmunologyChemistryAnatomyGeneCD8Genetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Thymus medulla epithelium establishes immune self-tolerance and comprises diverse cellular subsets.Functionally relevant medullary thymic epithelial cells (mTECs) include a selfantigen-displaying subset that exhibits genome-wide promiscuous gene expression promoted by the nuclear protein Aire and that resembles a mosaic of extrathymic cells including mucosal tuft cells.An additional mTEC subset produces the chemokine CCL21, thereby attracting positively selected thymocytes from the cortex to the medulla.Both self-antigen-displaying and thymocyteattracting mTEC subsets are essential for self-tolerance.Here, we identify a developmental pathway by which mTECs gain their diversity in functionally distinct subsets.We show that CCL21-expressing mTECs arise early during thymus ontogeny in mice.Fate-mapping analysis reveals that self-antigendisplaying mTECs, including Aire-expressing mTECs and thymic tuft cells, are derived from CCL21expressing cells.The differentiation capability of CCL21-expressing embryonic mTECs is verified in reaggregate thymus experiments.These results indicate that CCL21-expressing embryonic mTECs carry a developmental potential to give rise to self-antigen-displaying mTECs, revealing that the sequential conversion of thymocyte-attracting subset into self-antigen-displaying subset serves to assemble functional diversity in the thymus medulla epithelium. eLife assessmentThis important study provides new insights into the development and function of medullary thymus epithelial cells (mTEC).The authors provide compelling evidence to support their claims as to the differentiation and lineage outcomes of CCL21+ mTEC progenitors, which further our understanding of how central tolerance of T cells is enforced within the thymus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,090

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0270,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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