Longevity and environmental temperature modulate mitochondrial DNA evolution in fishes
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The link between longevity and mitochondrial function has been documented for years. Since mitochondrial DNA (mtDNA) encodes for electron transport system (ETS) proteins, we could suspect that its evolution is linked with that of longevity. A negative relationship has been documented between the synonymous substitution rate and lifespan when analyzing the whole mitochondrial genome in animals. In this study, we aimed to confirm this negative correlation for each of the mitochondrial protein coding genes (mtPCGs) and explore potential relationships between adaptation to extreme temperatures and the evolution of mtDNA. To this end, we selected 112 species of fish with a wide range of longevity as well as divergences in environmental temperature, which is a good proxy for energy metabolism in these animals. Our results 1) challenge the “rate of living” theory by not showing any correlation between longevity and environmental temperature, 2) confirm the negative relationship between substitution rate and longevity for each of the 13 mtPCGs, and 3) highlight for the first time a link between high conservation of the three COX genes and adaptation to warmer temperatures in fish. By challenging a paradigm and extending the conclusions made for mtDNA to individual genes, our study opens a wide field to be explored concerning study of the aging process. Moreover, the specific link between the evolution of COX genes and temperature tolerance confirms the importance of complex IV in adaptation to extreme temperatures and, more generally, the importance of distinguishing gene families when studying mtDNA evolution in animals.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».