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Enregistrement W4392658996 · doi:10.1080/07060661.2024.2317897

Occurrence and identification of two <i>Nothophoma</i> species causing branch canker and leaf brown spot of walnut in China

2024· article· en· W4392658996 sur OpenAlexvenueno aff
Cuiwen Zhang, Chengde Yang, Fengfeng Cai, Ting Ma, Lijuan Wei, Mengjun Jin, Yidan Wang, Na Qi

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesGansu Agricultural University
Mots-clésPhylogenetic treeBiologyCankerLocus (genetics)Internal transcribed spacerCladePhylogeneticsRibosomal RNABotanyGeneticsPathogenicityGeneMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In June 2020, branch canker and brown spot of leaves on walnut were observed in Qingyang, China. A total of five strains were isolated from symptomatic samples and verified for pathogenicity based on Koch’s Postulates, which showed that strains Hz4–1, Hz5–2, and Hy3–1 were the causative agents, and preliminarily identified them as members of the genus Nothophoma based on morphological characteristics. Subsequently, multi-locus phylogenetic analysis of the partial sequences of internal transcribed spacer (ITS), nuclear large ribosomal subunit (LSU), partial β-tubulin (TUB2), and RNA polymerase II second largest subunit (RPB2) showed that the three strains were clustered into two groups on the phylogenetic tree: strain Hz4–1 and Hz5–2 and Nothophoma quercina (CBS 6633.92) clustered into one branch with 84% support, while Hy3–1 and Nothophoma spiraeae (CFCC 53 929) clustered within a well-supported clade with a bootstrap value of 99%. As a result, combining morphological characteristics and multi-locus systematic analysis, the strains Hz4–1 and Hz5–2 were identified as N. quercina, and Hy3–1 was identified as N. spiraeae, which is the first report of N. spiraeae causing walnut disease in China.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,049

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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