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Enregistrement W4392683589 · doi:10.14785/lymphosign-2024-0001

Rare <i>FLG</i> mutation associated with severe atopy

2024· article· en· W4392683589 sur OpenAlexaffvenue
Azhar Abdullah Al Shaqaq, Lucy Dong Xuan Li, Daniele Merico, Julia Upton

Notice bibliographique

RevueLymphoSign Journal · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDermatology and Skin Diseases
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAtopyMutationMedicineGeneticsBiologyImmunologyImmunopathologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The prevalence of atopic disease, which consists of conditions such as atopic dermatitis, allergies, and asthma, has been on the rise in recent decades. In children, atopic dermatitis often acts as an initial manifestation of atopic disease and frequently precedes the development of food allergies, asthma, and allergic rhinitis. Mutations in the FLG gene, encoding the fillagrin precursor profillagrin, serve as a genetic risk factor for these diseases. Approximately 25%–50% of individuals with atopic dermatitis carry FLG mutations. It has been proposed that FLG mutations exhibit variations specific to different populations, indicating distinct patterns within each population. Severe allergic symptoms could indicate the presence of an underlying immunodeficiency or immune dysregulation and in patients with severe, early-onset, or simultaneous allergic conditions, these could be suggestive of an underlying Primary Atopic Disorder. Specifically, the allergic triad characterized by elevated IgE levels, eosinophilia, and eczema is a common feature in various inborn errors of immunity that could be mistakenly diagnosed as severe allergic conditions. Method: Our patient’s medical record was analyzed retrospectively, including her medical history, as well as results from immune laboratory tests and genetic analyses. Results: We present a 9-year-old female of mixed ethnicity with a history severe eczematous rash diagnosed with atopic dermatitis. Whole exome sequencing analysis revealed an initially novel heterozygous variant in the FLG gene (NM_002016: EXON3:c.C2218T: p.R740X). Conclusion: Healthcare providers caring for patients with atopic dermatitis and recurrent staphlococcus infections should be aware of the significant link between filaggrin gene mutations and the development of severe, persistent atopic dermatitis that begins in childhood, as well as its association with recurring staphlococcus infections. Additionally, they should keep in mind that certain inborn errors of immunity may predominantly manifest as severe and treatment-resistant atopic disorders. Statement of novelty: We have identified a rare variant in the FLG gene associated with severe atopic dermatitis and allergies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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