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Enregistrement W4392697008 · doi:10.1371/journal.pone.0299271

Time series classification of multi-channel nerve cuff recordings using deep learning

2024· article· en· W4392697008 sur OpenAlexafffund
Aseem Partap Singh Gill, José Zariffa

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueEEG and Brain-Computer Interfaces
Établissements canadiensUniversity Health NetworkToronto Rehabilitation InstituteUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésNeurostimulationCuffComputer scienceFunctional electrical stimulationMedicineBiomedical engineeringStimulationSurgeryInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neurostimulation and neural recording are crucial to develop neuroprostheses that can restore function to individuals living with disabilities. While neurostimulation has been successfully translated into clinical use for several applications, it remains challenging to robustly collect and interpret neural recordings, especially for chronic applications. Nerve cuff electrodes offer a viable option for recording nerve signals, with long-term implantation success. However, nerve cuff electrodes' signals have low signal-to-noise ratios, resulting in reduced selectivity between neural pathways. The objective of this study was to determine whether deep learning techniques, specifically networks tailored for time series applications, can increase the recording selectivity achievable using multi-contact nerve cuff electrodes. We compared several neural network architectures, the impact and trade-off of window length on classification performance, and the benefit of data augmentation. Evaluation was carried out using a previously collected dataset of 56-channel nerve cuff recordings from the sciatic nerve of Long-Evans rats, which included afferent signals evoked using three types of mechanical stimuli. Through this study, the best model achieved an accuracy of 0.936 ± 0.084 and an F1-score of 0.917 ± 0.103, using 50 ms windows of data and an augmented training set. These results demonstrate the effectiveness of applying CNNs designed for time-series data to peripheral nerve recordings, and provide insights into the relationship between window duration and classification performance in this application.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,111
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,169 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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