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Enregistrement W4392710158 · doi:10.1002/edn3.524

<scp>DNA</scp> from dives: Species detection of humpback whales (<i>Megaptera novaeangliae</i>) from flukeprint <scp>eDNA</scp>

2024· article· en· W4392710158 sur OpenAlex
Chloe V. Robinson, Karina Dracott, Robin Glover, Adam Warner, Amy Migneault

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueEnvironmental DNA · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensRaincoast Conservation FoundationFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesFisheries and Oceans Canada
Mots-clésHumpback whaleFisheryEnvironmental DNAWhaleHabitatBiologyPorpoiseWhalingInvasive speciesPopulationCetaceaGeographyEcologyBiodiversityHarbour

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Northern British Columbia has been identified as an important habitat for several coastal cetacean species, including humpback whales ( Megaptera novaeangliae ). This species is listed as being of “Special Concern” under Canada's Species at Risk Act, partly due to data deficiencies concerning genetic population structure and demographics in British Columbia. Anthropogenic activities threaten North Coast humpback whale populations, with particular concern for the impact of vessel noise, entanglement, and ship strikes. Current methodology (i.e., biopsy sampling) for obtaining cetacean genetic data is invasive, challenging, and costly; therefore, there is an urgency to develop effective and minimally invasive methodologies for efficiently collecting this data. Environmental DNA (eDNA) has been identified as an ideal tool for monitoring the presence and distribution of numerous species within marine ecosystems; however, the feasibility for cetaceans is not yet well established. In this study, we opportunistically collected targeted 1 L seawater eDNA samples from flukeprints when individual humpback whales were observed diving between the years of 2020 and 2022. A total of 93 samples were collected from individual humpback whales identified using a photographic identification catalogue. We successfully detected humpback whale eDNA in 28 samples using novel species‐specific qPCR primers (~500 mL of sample), with relatively equal successful detection between immediate (0 days) and delayed (up to 10 days) sample filtration. Here, we have validated a qPCR assay for detecting humpback whale DNA from flukeprints and highlighted the future optimizations required to improve the potential application of flukeprint eDNA for conservation management.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,330
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle