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Enregistrement W4392735028 · doi:10.4167/jbv.2023.53.2.150

Spa Typing and Virulence Attributes of Multidrug-Resistant Staphylococcus aureus in Goat: A Veterinary Hospital-Based Cross-Sectional Study

2023· article· en· W4392735028 sur OpenAlexaff
Avijit Dutta, Chandan Nath, Md Moktadir Billah Reza, Tridip Das, Eaftekhar Ahmed Rana, Ayesha Sultana, Mohammad Jalal

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology and Virology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesChattogram Veterinary and Animal Sciences University
Mots-clésMultiple drug resistanceStaphylococcus aureusTypingMicrobiologyVirulenceVeterinary medicineMedicineBiologyDrug resistanceBacteriaGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Staphylococcus aureus (S. aureus) not only causes significant loss of livestock production but also has potential public health risks. This study was conducted with the objective of characterizing the antibiogram of S. aureus from goats attending a Teaching Veterinary Hospital in Bangladesh. We aimed to study the spa type, potential virulence factor(s), and the presence of methicillin and vancomycin resistance genes in the isolates. From a total of 200 goat nasal swab samples S. aureus was confirmed by PCR. Antimicrobial susceptibility testing was performed using the disc diffusion method followed by mecA and vanA gene PCR. Staphylococcal protein A (spa) typing was conducted for selected isolates. A set of major virulence determinants, including sea, seb, pvl, and tst were investigated by PCR. A total 11.5% (n=23) of S. aureus isolates were obtained. Ciprofloxacin resistance was the highest (100%; n=23) followed by cefoxitin (74%; n=17). About 91% of the isolates (n=21) were multidrug-resistant (resistant to ≥3 antimicrobial classes). One (6%) isolate was MRSA harboring mecA. Among 13 vancomycin-resistant isolates, three (23%) were vanA-positive. Of the virulence genes screened, sea was recorded in four (17%) isolates. The spa typing of two randomly selected strains revealed that one isolate belonged to spa type t5259, and the other seemed to be novel. Goats having cutaneous and mucosal lesions had higher S. aureus carriage (P=0.01) with a significant variation across the breeds (P= 0.02). This study provides insights into S. aureus strains circulating in the goat population in Bangladesh.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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