Contributions of Common Genetic Variants to Constitutional Delay of Puberty and Idiopathic Hypogonadotropic Hypogonadism
Notice bibliographique
Résumé
CONTEXT: Constitutional delay of puberty (CDP) is highly heritable, but the genetic basis for CDP is largely unknown. Idiopathic hypogonadotropic hypogonadism (IHH) can be caused by rare genetic variants, but in about half of cases, no rare-variant cause is found. OBJECTIVE: To determine whether common genetic variants that influence pubertal timing contribute to CDP and IHH. DESIGN: Case-control study. PARTICIPANTS: 80 individuals with CDP; 301 with normosmic IHH, and 348 with Kallmann syndrome (KS); control genotyping data from unrelated studies. MAIN OUTCOME MEASURES: Polygenic scores (PGS) based on genome-wide association studies for timing of male pubertal hallmarks and age at menarche (AAM). RESULTS: The CDP cohort had higher PGS for male pubertal hallmarks and for AAM compared to controls (for male hallmarks, Cohen's d = 0.67, P = 1 × 10-10; for AAM, d = 0.85, P = 1 × 10-16). The normosmic IHH cohort also had higher PGS for male hallmarks compared to controls, but the difference was smaller (male hallmarks d = 0.20, P = .003; AAM d = 0.10, P = .055). No differences were seen for the KS cohort compared to controls (male hallmarks d = 0.05, P = .45; AAM d = 0.03, P = .56). CONCLUSION: Common genetic variants that influence pubertal timing in the general population contribute strongly to the genetics of CDP, weakly to normosmic IHH, and potentially not at all to KS. These findings demonstrate that the common-variant genetics of CDP and normosmic IHH are largely but not entirely distinct.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».