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Enregistrement W4392763057 · doi:10.3390/ijms25063258

Multiple Roles of Glycerate Kinase—From Photorespiration to Gluconeogenesis, C4 Metabolism, and Plant Immunity

2024· article· en· W4392763057 sur OpenAlexaff
Leszek A. Kleczkowski, Abir U. Igamberdiev

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant nutrient uptake and metabolism
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesUmeå Universitet
Mots-clésPhotorespirationMetabolismGluconeogenesisBiologyPlant ImmunityImmunityBiochemistryBotanyEnzymeImmune systemArabidopsisGeneticsGeneMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plant glycerate kinase (GK) was previously considered an exclusively chloroplastic enzyme of the glycolate pathway (photorespiration), and its sole predicted role was to return most of the glycolate-derived carbon (as glycerate) to the Calvin cycle. However, recent discovery of cytosolic GK revealed metabolic links for glycerate to other processes. Although GK was initially proposed as being solely regulated by substrate availability, subsequent discoveries of its redox regulation and the light involvement in the production of chloroplastic and cytosolic GK isoforms have indicated a more refined regulation of the pathways of glycerate conversion. Here, we re-evaluate the importance of GK and emphasize its multifaceted role in plants. Thus, GK can be a major player in several branches of primary metabolism, including the glycolate pathway, gluconeogenesis, glycolysis, and C4 metabolism. In addition, recently, the chloroplastic (but not cytosolic) GK isoform was implicated as part of a light-dependent plant immune response to pathogen attack. The origins of glycerate are also discussed here; it is produced in several cell compartments and undergoes huge fluctuations depending on light/dark conditions. The recent discovery of the vacuolar glycerate transporter adds yet another layer to our understanding of glycerate transport/metabolism and that of other two- and three-carbon metabolites.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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