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Enregistrement W4392767858 · doi:10.1016/j.gimo.2024.101837

Exploring the phenotypic spectrum and osteopenia mechanisms in Yunis-Varón syndrome

2024· article· en· W4392767858 sur OpenAlexafffund
Éliane Beauregard‐Lacroix, Alexandra J. Scott, Thi Tuyet Mai Nguyen, Klaas J. Wierenga, Gabriela Purcarin, Anne B. Karstensen, Daniel R. Carvalho, Jean‐Luc Alessandri, Frédérique Payet, Katta M. Girisha, Mathieu Ferron, Philippe M. Campeau

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine Open · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensMontreal Clinical Research InstituteUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchCHU Sainte-Justine Foundation
Mots-clésOsteopeniaPhenotypeMedicineGeneticsInternal medicineBiologyGeneBone mineralOsteoporosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose Biallelic variants in FIG4 or VAC14 are associated with Yunis-Varón syndrome (YVS), which is characterized by multisystem involvement including skeletal findings, craniofacial dysmorphisms and central nervous system anomalies. Pathogenic variants in those same genes have also been associated with a predominantly neurological phenotype and with nonsyndromic conditions, such as Charcot-Marie-Tooth disease and amyotrophic lateral sclerosis. By describing 5 new cases of FIG4 -associated YVS and reviewing the literature, we better delineate the clinical phenotype associated with loss of function of those genes. We also explore osteopenia mechanisms by assessing bone physiologic parameters in a mouse model. Methods Exome sequencing or Sanger sequencing was performed in 5 unrelated individuals. Bone histomorphometry was performed in Fig4 plt/plt mice and compared with wild type. Relevant literature from the last 10 years was reviewed. Results All individuals presented a phenotype overlapping the typical YVS and the brain anomalies and neurologic syndrome. Clinical features included developmental delay, structural brain malformations, and skeletal anomalies, such as osteopenia. Biallelic FIG4 variants were identified in each individual. In mice, bone histomorphometry parameters suggested that osteopenia might be secondary to reduced bone formation rather than increased bone degradation. Conclusion This study contributes to a better understanding of the phenotypic variability caused by pathogenic variants in FIG4 or VAC14 and suggests an important overlap between previously described phenotypes. The brain anomalies and neurologic syndrome is likely in the same spectrum as classical YVS. Further studies are still needed to clarify the effects of partial loss-of-function (hypomorphic) variants and to identify genotype-phenotype correlations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,470
Score d'incertitude au seuil0,798

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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