Defining the contribution of microRNA-specific Argonautes with slicer capability in animals
Notice bibliographique
Résumé
microRNAs regulate gene expression through interaction with an Argonaute protein. While some members of this protein family retain an enzymatic activity capable of cleaving RNA molecules complementary to Argonaute-bound small RNAs, the role of the slicer residues in the canonical microRNA pathway is still unclear in animals. To address this, we created Caenorhabditis elegans strains with mutated slicer residues in the endogenous ALG-1 and ALG-2, the only two slicing Argonautes essential for the miRNA pathway in this animal model. We observe that the mutation in ALG-1 and ALG-2 catalytic residues affects overall animal fitness and causes phenotypes reminiscent of miRNA defects only when grown and maintained at restrictive temperature. Furthermore, the analysis of global miRNA expression shows that the slicer residues of ALG-1 and ALG-2 contribute differentially to regulate the level of specific subsets of miRNAs in young adults. We also demonstrate that altering the catalytic tetrad of those miRNA-specific Argonautes does not result in any defect in the production of canonical miRNAs. Together, these data support that the slicer residues of miRNA-specific Argonautes contribute to maintaining levels of a set of miRNAs for optimal viability and fitness in animals particularly exposed to specific growing conditions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».