MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4392853463 · doi:10.1038/s41467-024-46665-2

Translation efficiency driven by CNOT3 subunit of the CCR4-NOT complex promotes leukemogenesis

2024· article· en· W4392853463 sur OpenAlexafffund
Maryam Ghashghaei, Yilin Liu, James Ettles, Giuseppe Bombaci, Niveditha Ramkumar, Zongmin Liu, Leo Escano, Sandra E. Spencer Miko, Yerin Kim, Joseph A. Waldron, Kim Do, Kyle MacPherson, Katie A. Yuen, Thilelli Taibi, Marty Yue, Aaremish Arsalan, Zhen Jin, Glenn Edin, Aly Karsan, Gregg B. Morin, Florian Kuchenbauer, Fabiana Perna, Martin Bushell, Ly Vu

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensGenome British ColumbiaTerry Fox Research InstituteUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Cancer InstituteCancer Research UKBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilOregon Health and Science UniversityKnight Cancer Institute, Oregon Health and Science UniversityLeukemia and Lymphoma SocietyAmerican Society of Hematology
Mots-clésProtein subunitTranslation (biology)Cell biologyComputer scienceComputational biologyBiologyGeneticsMessenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protein synthesis is frequently deregulated during tumorigenesis. However, the precise contexts of selective translational control and the regulators of such mechanisms in cancer is poorly understood. Here, we uncovered CNOT3, a subunit of the CCR4-NOT complex, as an essential modulator of translation in myeloid leukemia. Elevated CNOT3 expression correlates with unfavorable outcomes in patients with acute myeloid leukemia (AML). CNOT3 depletion induces differentiation and apoptosis and delayed leukemogenesis. Transcriptomic and proteomic profiling uncovers c-MYC as a critical downstream target which is translationally regulated by CNOT3. Global analysis of mRNA features demonstrates that CNOT3 selectively influences expression of target genes in a codon usage dependent manner. Furthermore, CNOT3 associates with the protein network largely consisting of ribosomal proteins and translation elongation factors in leukemia cells. Overall, our work elicits the direct requirement for translation efficiency in tumorigenesis and propose targeting the post-transcriptional circuitry via CNOT3 as a therapeutic vulnerability in AML.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,737
Score d'incertitude au seuil0,275

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNature CommunicationsMême sujetRNA modifications and cancerTravaux en français237 207