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Enregistrement W4392879776 · doi:10.14740/jocmr5111

Alpha-1 Antitrypsin Phenotyping: An Unmet Educational Need of Healthcare Providers

2024· article· en· W4392879776 sur OpenAlexvenueno aff
Zane Elfessi, Neetu Thomas, Michael L. Wong, Israel Rubinstein

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Medicine Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésMedicineVeterans AffairsConcomitantPulmonary function testingAlpha 1-antitrypsin deficiencyInternal medicineLung diseaseLungMedical recordGastroenterology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Diagnosing alpha-1 antitrypsin deficiency (A1ATD) involves two-step laboratory testing, determination of serum alpha-1 antitrypsin (A1AT) level and phenotyping if A1AT < 100 mg/dL. Whether these guidelines are effectuated in clinical practice is uncertain. To begin to address this issue, we determined whether A1AT phenotyping is performed in patients with serum A1AT 57 - 99 mg/dL at our institution. Methods: We reviewed the medical records of patients seen at Jesse Brown Veterans Affairs Medical Center from January 2019 to October 2022 with serum A1AT between 57 and 99 mg/dL. In each case, pertinent demographic, clinical, and pulmonary function tests data were extracted. Data were presented as means and standard deviation (SD) where appropriate. The Student's t -test was used for statistical analysis. P < 0.05 was considered statistically significant. Results: Thirty patients (90% males; 60 ± 18 years) with serum A1ATD < 100 mg/mL were identified. Fourteen were African Americans, four Hispanics, and 12 non-Hispanic Whites. The majority were current or ex-smokers. Fourteen (47%) patients had lung disease, 14 (47%) liver disease and one had concomitant lung and liver diseases. Mean ± SD forced expiratory volume in 1 s (FEV 1 ) and lung diffusing capacity were 2.57 ± 1.41 L (67±19% predicated) and 18.7 ± 10 mL/min/mm Hg (64±28% predicted), respectively. Only 13 patients (43%) underwent phenotype testing (seven African Americans, five Whites, and one Hispanic). Six patients had MZ phenotype, four MS, and three SZ. One patient died from acute respiratory failure during the study period. Conclusions: Phenotyping of patients with serum A1AT 57 - 99 mg/dL at our institution is inadequate. Accordingly, regular continuous medical educational programs on A1AT phenotyping targeting healthcare providers are warranted. J Clin Med Res. 2024;16(2-3):124-127 doi: https://doi.org/10.14740/jocmr5111

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,013
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,037

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,013
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0040,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,184
Tête enseignante GPT0,552
Écart entre enseignants0,368 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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