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Enregistrement W4392886250 · doi:10.1038/s41598-023-49501-7

Administrative data ICD-10 diagnostic codes identifies most lab-confirmed SARS-CoV-2 admissions but misses many discharged from the Emergency Department

2024· article· en· W4392886250 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiqueMedical Coding and Health Information
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of TorontoHealth Sciences CentreVancouver General HospitalMcGill University Health CentreSunnybrook Health Science CentreMcGill University
Organismes subventionnairesMinistry of Colleges and UniversitiesCanadian Institutes of Health ResearchFondation CHU de QuébecGenome British ColumbiaSaskatchewan Health Research Foundation
Mots-clésEmergency departmentSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)2019-20 coronavirus outbreakMedicineDiagnosis codeMedical emergencyEmergency medicineVirologyInternal medicineNursingOutbreak

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We estimated the operating characteristics of ICD-10 code U07.1, introduced by the World Health Organization in 2020, to identify lab-confirmed SARS-CoV-2. CCEDRRN is a national research registry of adults (March 2020-August 2021) with suspected/confirmed SARS-CoV-2 identified in Canadian emergency departments (EDs) using chart review (symptoms, clinical information, and lab test results including SARS-CoV-2 polymerase chain reaction, PCR results). CCEDRRN data were linked to administrative hospitalization discharge and ED ICD-10 diagnostic codes (accessed centrally via the Canadian Institute for Health Information). We identified ICD-10 diagnostic codes in CCEDRRN participants. We defined lab-confirmed SARS-CoV-2 based on at least one positive PCR in the 0-14 days before the ED presentation and/or during hospitalization (in those admitted from ED). We performed separate analyses for CCEDRRN participants discharged from ED and those hospitalized from the ED. Additional analyses were stratified by province, sex, age, and (for hospitalized patients) timing of the first PCR test. The sensitivity of ICD-10 code U07.1 for a positive SARS-CoV-2 test was 93.6% (95% CI 93.0-94.1%) in those hospitalized from ED and 83.0% (95% CI 82.1-83.9%) in those discharged from the ED. Sensitivity was similar across provinces and demographics, but in each stratified analysis, values were higher in those hospitalized versus those discharged from ED. The ICD-10 diagnostic code for U07.1 within administrative data identified most lab-confirmed SARS-CoV-2 within persons hospitalized from ED, although a significant number of cases discharged from ED were missed. This should be considered when using administrative data for research and public health planning.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Études des sciences et des technologies, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,062
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0040,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,298
Tête enseignante GPT0,488
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle