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Enregistrement W4392888377 · doi:10.1002/edn3.529

Oomycete communities are influenced by land use and disease status in Christmas tree production in Southern Québec, Canada

2024· article· en· W4392888377 sur OpenAlex
Hervé Van der Heyden, Marc‐Olivier Duceppe, Guillaume Charron, Philippe Tanguay, Guillaume J. Bilodeau

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueEnvironmental DNA · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensNatural Resources CanadaCanadian Food Inspection AgencyAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesMinistère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Mots-clésOomycetePhytophthoraSpecies richnessBiodiversityPhytophthora cinnamomiThreatened speciesContext (archaeology)GeographyEcologyBiologyHabitatBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Forests are threatened by many natural stressors intensified by climate change and anthropogenic activities, which tend to increase their susceptibility to pests and pathogens. Consequently, oomycete‐related forest decline or dieback cases are increasing in natural, urban, and agricultural landscapes. It is in this context that Christmas tree growers from Southern Québec, Canada, are experiencing root rot problems, with reported incidences up to 25%. In a previous study, seven Phytophthora spp. were associated with this root rot problem, but the overall diversity of oomycetes has not yet been investigated. Hence, in this study, we use a metabarcoding approach to provide an overview of the diversity, richness, and composition of the oomycete community in fir plantations compared to surrounding natural forests. We showed that the P. cryptogea cluster, P. europaea cluster, P. sansomeana , and P. chlamydospora cluster were significantly more abundant in soils collected from plantations under diseased trees and confirmed that the P. europaea cluster (including P. abietivora ) was most frequently associated with trees showing Phytophthora root rot‐like symptoms. Finally, we report that land use (anthropogenic activities) shapes oomycete diversity, while plantations can act as a gateway for invading natural forests. In fact, the results presented here suggested that the P. europaea cluster might already have crossed this boundary and that other species might follow, advocating the importance of improved surveillance of oomycete diversity in various environments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,353
Score d'incertitude au seuil0,372

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,156
Écart entre enseignants0,149 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle