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Enregistrement W4392898042 · doi:10.1101/2024.03.15.585204

Myocardin-related transcription factor drives epithelial fibrogenesis in polycystic kidney disease

2024· preprint· en· W4392898042 sur OpenAlexafffund
Zsuzsanna Lichner, Mei Ding, Tarang Khare, Qinghong Dan, Raquel Benítez, Mercédesz Praszner, Xuewen Song, Rola Saleeb, Boris Hinz, York Pei, Katalin Szászi, András Kapùs

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of TorontoAptose Biosciences (Canada)St. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of TorontoKidney Foundation of Canada
Mots-clésRHOAMyocardinCell biologyPolycystic kidney diseaseBiologyCancer researchParacrine signallingMyofibroblastFibrosisEpithelial–mesenchymal transitionActin cytoskeletonTranscription factorDownregulation and upregulationCytoskeletonEndocrinologyPathologySerum response factorKidneySignal transductionMedicineCellReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Polycystic kidney disease (PKD) is characterized by extensive cyst formation and progressive fibrosis. However, the molecular mechanisms whereby the loss/loss-of-function of Polycystin 1 or 2 (PC1/2) provokes fibrosis are largely unknown. The small GTPase RhoA has been recently implicated in cystogenesis , and we have shown that the RhoA/cytoskeleton/myocardin-related transcription factor (MRTF) pathway is a key mediator of epithelium-induced fibrogenesis. Therefore, we hypothesized that MRTF is activated by PC1/2 loss and plays a critical role in fibrogenic reprogramming of the epithelium. Loss of PC1 or PC2 induced by siRNA in vitro activated RhoA, caused cytoskeletal remodeling and robust nuclear MRTF translocation and overexpression. These phenomena were also manifest in PKD1 (RC/RC) and PKD2 (WS25/-) mice, with MRTF translocation and overexpression occurring predominantly in dilated tubules and in cyst-lining epithelium, respectively. In epithelial cells, a large cohort of PC1/PC2 downregulation-induced genes was MRTF-dependent, including cytoskeletal, integrin-related, and matricellular/fibrogenic proteins. Epithelial MRTF was necessary for paracrine priming of fibroblast-myofibroblast transition. Thus, MRTF is a critical novel mediator of the PC1/2 loss-induced profibrotic epithelial phenotype, and consequently PKD-related fibrosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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