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Enregistrement W4392935409 · doi:10.1088/1741-2552/ad357e

Functional brain network controllability dysfunction in Alzheimer’s disease and its relationship with cognition and gene expression profiling

2024· article· en· W4392935409 sur OpenAlexfundno aff
Chuchu Zheng, Xiaoxia Xiao, Wei Zhao, Zeyu Yang, Shuixia Guo

Notice bibliographique

RevueJournal of Neural Engineering · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingCanadian Institutes of Health ResearchNatural Science Foundation of Hunan ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésControllabilityNetwork controllabilityDefault mode networkTranscriptomeCorrelationResting state fMRIComputational biologyGene regulatory networkCognitionNeuroscienceBiologyMedicineGeneGene expressionGeneticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objective . In recent studies, network control theory has been applied to clarify transitions between brain states, emphasizing the significance of assessing the controllability of brain networks in facilitating transitions from one state to another. Despite these advancements, the potential alterations in functional network controllability associated with Alzheimer’s disease (AD), along with the underlying genetic mechanisms responsible for these alterations, remain unclear. Approach . We conducted a comparative analysis of functional network controllability measures between patients with AD ( n = 64) and matched normal controls (NCs, n = 64). We investigated the association between altered controllability measures and cognitive function in AD. Additionally, we conducted correlation analyses in conjunction with the Allen Human Brain Atlas to identify genes whose expression was correlated with changes in functional network controllability in AD, followed by a set of analyses on the functional features of the identified genes. Main results . In comparison to NCs, patients with AD exhibited a reduction in average controllability, predominantly within the default mode network (DMN) (63% of parcellations), and an increase in average controllability within the limbic (LIM) network (33% of parcellations). Conversely, AD patients displayed a decrease in modal controllability within the LIM network (27% of parcellations) and an increase in modal controllability within the DMN (80% of parcellations). In AD patients, a significant positive correlation was found between the average controllability of the salience network and the mini-mental state examination scores. The changes in controllability measures exhibited spatial correlation with transcriptome profiles. The significant genes identified exhibited enrichment in neurobiologically relevant pathways and demonstrated preferential expression in various tissues, cell types, and developmental periods. Significance . Our findings have the potential to offer new insights into the genetic mechanisms underlying alterations in the controllability of functional networks in AD. Additionally, these results offered perspectives for a deeper understanding of the pathogenesis and the development of therapeutic strategies for AD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,506
Score d'incertitude au seuil0,391

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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