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Enregistrement W4392968995 · doi:10.1101/2024.03.14.584861

PRMT5 is required for full-length <i>HTT</i> expression by repressing multiple proximal intronic polyadenylation sites

2024· preprint· en· W4392968995 sur OpenAlexafffund
Mona Alqazzaz, Felipe E. Ciamponi, Jolene Caifeng Ho, Maxim I. Maron, Manisha Yadav, Aiden M. Sababi, Graham MacLeod, Moloud Ahmadi, Garrett Bullivant, Vincent Tano, Sarah R. Langley, María Sánchez‐Osuna, Patty Sachamitr, Michelle Kushida, Laura M. Richards, Costanza Ferrari Bardile, Mahmoud A. Pouladi, Trevor J. Pugh, Mike Tyers, Stéphane Angers, Peter B. Dirks, Gary D. Bader, Katlin B. Massirer, Dalia Baršytė-Lovejoy, David Shechter, Rachel Harding, C.H. Arrowsmith, Panagiotis Prinos

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensSinai Health SystemOntario Institute for Cancer ResearchHospital for Sick ChildrenUniversité de MontréalUniversity of British ColumbiaSickKids FoundationInstitute for Research in Immunology and CancerLunenfeld-Tanenbaum Research InstitutePrincess Margaret Cancer CentreBC Children's HospitalUniversity of TorontoUniversity Health NetworkStructural Genomics Consortium
Organismes subventionnairesMitacsGovernment of CanadaGovernment of OntarioStand Up To CancerGenome Canada
Mots-clésPolyadenylationRNA splicingHuntingtinExonIntronBiologyAlternative splicingTrinucleotide repeat expansionMolecular biologyCell biologyMessenger RNAGeneticsGeneAlleleRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Expansion of the CAG trinucleotide repeat tract in exon 1 of the Huntingtin ( HTT ) gene above a threshold of ∼36 repeats causes Huntington’s disease (HD) through the expression of a polyglutamine-expanded form of the HTT protein. This mutation triggers wide-ranging cellular and biochemical pathologies leading to cognitive, motor, and psychiatric symptoms in HD patients. As accurate splicing is required to produce the full-length HTT protein of ∼348 kDa, targeting HTT splicing with small molecule drugs is a compelling approach to lower HTT protein levels to treat HD, and splice modulators are being tested in the clinic. Here, we identify PRMT5 as a novel regulator of HTT mRNA splicing and alternative polyadenylation. PRMT5 inhibition disrupts the splicing of HTT introns 9 and 10, leading to activation of multiple proximal intronic polyadenylation sites within these introns and promoting premature termination, cleavage and polyadenylation (PCPA) of the HTT mRNA, thus lowering total HTT protein levels. We also detected increasing levels of these truncated, intron-containing HTT transcripts across a series of neuronal differentiation samples which correlated with lower PRMT5 expression. Notably, PRMT5 inhibition in glioblastoma (GBM) stem cells potently induced neuronal differentiation. We posit that PRMT5-mediated regulation of intronic polyadenylation, premature termination and cleavage of the HTT mRNA modulates HTT expression and plays an important role during embryonic development and neuronal differentiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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