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Enregistrement W4393032253 · doi:10.21203/rs.3.rs-4124728/v1

Microbe-binding antibodies in the female genital tract: associations with the vaginal microbiome and genital immunology

2024· preprint· en· W4393032253 sur OpenAlexafffund
Rachel Liu, James Pollock, Sanja Huibner, Suji Udayakumar, Erastus Irungu, Pauline Ngurukiri, Peter Muthoga, Wendy Adhiambo, Joshua Kimani, Tara Beattie, Bryan Coburn, Rupert Kaul

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchForeign, Commonwealth and Development Office
Mots-clésMicrobiomeFemale circumcisionGenital tractSex organImmunologyAntibodyBiologyMucosal immunityMedicinePhysiologyImmunityImmune systemGynecologyBioinformaticsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Mucosal antibodies in the gut maintain homeostasis between the host and the local microbiome through the clearance of pathogenic bacteria and the development of immune tolerance to inflammatory bacteria. Whether similar bacteria-immunoglobulin interactions modulate cervicovaginal inflammation and/or bacterial colonization in the female genital tract (FGT) is not well understood. Here, we used a flow cytometry-based assay to quantify microbe-binding IgA and IgG in the cervicovaginal secretions of 200 HIV-uninfected women from Nairobi, Kenya that were enriched for bacterial vaginosis (BV) and evaluated the associations of cervicovaginal IgA and IgG with the vaginal microbiome composition and local soluble immune factors. Results Total IgA and IgG were abundant in cervicovaginal secretions and frequently demonstrated ex vivo binding to key vaginal bacteria species Gardnerella vaginalis, Prevotella bivia, Lactobacillus iners, and Lactobacillus crispatus. Microbe-binding antibodies were generally not associated with the presence/absence of the corresponding bacteria. Total and microbe-binding IgA and IgG were inversely correlated with total bacterial abundance and positively correlated with several pro-inflammatory cytokines (IL-6, TNF) and chemotactic chemokines (IP-10, MIG, MIP-1α, MIP-1β, MIP-3α, MCP-1, IL-8), independent of total bacterial abundance. Conclusions Flow cytometry-based quantification of microbe-binding antibodies provides a platform to investigate host-microbiota interactions in the FGT of human observational and interventional studies. In contrast to the gut, cervicovaginal microbe-binding IgA and IgG do not appear to be immunoregulatory but may indirectly mitigate bacteria-induced inflammation by reducing total bacterial abundance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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