MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4393032454 · doi:10.1183/23120541.00968-2023

Enhancing COPD classification using combined quantitative computed tomography and texture-based radiomics: a CanCOLD cohort study

2024· article· en· W4393032454 sur OpenAlexafffundabout
Kalysta Makimoto, James C. Hogg, Jean Bourbeau, Wan C. Tan, Miranda Kirby

Notice bibliographique

RevueERJ Open Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensRoyal Victoria HospitalMcGill University Health CentreUniversity of British ColumbiaToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesUniversity of TorontoDalhousie UniversityUniversity of OttawaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaQueen's UniversityJohns Hopkins UniversityMcGill UniversityAmerican Thoracic Society
Mots-clésMedicineRadiomicsCohortCOPDTexture (cosmology)RadiologyMedical physicsArtificial intelligenceInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Recent advances in texture-based computed tomography (CT) radiomics have demonstrated its potential for classifying COPD. Methods: Participants from the Canadian Cohort Obstructive Lung Disease (CanCOLD) study were evaluated. A total of 108 features were included: eight quantitative CT (qCT), 95 texture-based radiomic and five demographic features. Machine-learning models included demographics along with texture-based radiomics and/or qCT. Combinations of five feature selection and five classification methods were evaluated; a training dataset was used for feature selection and to train the models, and a testing dataset was used for model evaluation. Models for classifying COPD status and severity were evaluated using the area under the receiver operating characteristic curve (AUC) with DeLong's test for comparison. SHapely Additive exPlanations (SHAP) analysis was used to investigate the features selected. Results: A total of 1204 participants were evaluated (n=602 no COPD; n=602 COPD). There were no differences between the groups for sex (p=0.77) or body mass index (p=0.21). For classifying COPD status, the combination of demographics, texture-based radiomics and qCT performed better (AUC=0.87) than the combination of demographics and texture-based radiomics (AUC=0.81, p<0.05) or qCT alone (AUC=0.84, p<0.05). Similarly, for classifying COPD severity, the combination of demographics, texture-based radiomics and qCT performed better (AUC=0.81) than demographics and texture-based radiomics (AUC=0.72, p<0.05) or qCT alone (AUC=0.79, p<0.05). Texture-based radiomics and qCT features were among the top five features selected (15th percentile of the CT density histogram, CT total airway count, pack-years, CT grey-level distance zone matrix zone distance entropy, CT low-attenuation clusters) for classifying COPD status. Conclusion: Texture-based radiomics and conventional qCT features in combination improve machine‑learning models for classification of COPD status and severity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,785
Score d'incertitude au seuil0,670

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,105
Tête enseignante GPT0,459
Écart entre enseignants0,353 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueERJ Open ResearchMême sujetRadiomics and Machine Learning in Medical ImagingTravaux en français237 207