MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4393076009 · doi:10.1158/1538-7445.am2024-5846

Abstract 5846: Inhibiting elements of the proteasome recovery pathway sensitizes glioblastoma to proteasome inhibitors

2024· article· en· W4393076009 sur OpenAlexaff
Alisha Anand, Muhammad Vaseem Shaikh, Chirayu Chokshi, Benjamin Brakel, William Maich, Shan Grewal, Chitra Venugopal, Sheila K. Singh

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProteasomeGlioblastomaCancer researchMedicineBiologyCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Bacground: Glioblastoma (GBM) is the most common primary brain tumor, accounting for 15% of all central nervous system related tumors. Despite the aggressive standard of care treatment including chemotherapy, radiotherapy, and maximally safe surgical resection, patient outcomes are abysmal: with 95% of patients relapsing and a median overall survival of 15 months. Thus, this necessitates the rapid query for personalized therapeutics and agents that can potentiate the clinical effects of currently approved treatments. One such pathway that demonstrates aberrant functioning in cancer and is a targetable mechanism is the ubiquitin-proteosome pathway (UPP). Studies have shown that UPP related proteolysis remains constitutively active in cancer cells leading to the rapid degradation of proteins that regulate tumor suppressor genes and oncogenes. Despite robust preclinical evaluations for the usage of proteosome inhibitors against GBM, most tested proteosome inhibitors failed in phase II and III trials, indicating resistance. Methods: We conducted an unbiased genome wide CRISPR-Cas9 screen in human HAP1 cells treated with the proteosome inhibitor, Bortezomib (BTZ), to identify genes that may lead to a BTZ-resistant phenotype. We identified several genes that when perturbed, sensitized cells to BTZ including N-glycanase-1 (NGLY-1), Nuclear factor Erythroid 2-Like-1 (NFE2L1), and DNA damage inducible 1 homolog 2 (DDI2). Herein we sought to evaluate the effects of perturbing components of the proteosome rescue pathway in our Singh lab patient derived GBM cell lines by utilizing CRISPR/Cas9 knockout technology in vitro and in vivo. Results: The generation of NGLY-1, DDI2, and NFE2L1 KO cell lines demonstrated functional sensitivity to the proteosome inhibitor Marizomib (MZB) as observed through a significant reduction of the IC50 in the KO cell lines compared to a control. Functional evaluation also revealed a reduction in proliferation capacity as well as sphere formation in these genetically modified GBM lines. Ongoing in vivo work will aim to evaluate the mitigation of this resistant pathway in our NSG mouse models orthotopically transplanted with these patient derived KO cell lines. In an ongoing collaborative effort, we are working to identify and functionally assess a novel small molecule NGLY-1 inhibitor to evaluate preclinical sensitivity to MZB in our in vitro and in vivo models. Citation Format: Alisha Anand, Muhammad Vaseem Shaikh, Chirayu Chokshi, Benjamin Brakel, William Maich, Shan Grewal, Chitra Venugopal, Sheila Singh. Inhibiting elements of the proteasome recovery pathway sensitizes glioblastoma to proteasome inhibitors [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2024; Part 1 (Regular Abstracts); 2024 Apr 5-10; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(6_Suppl):Abstract nr 5846.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer Research→Même sujetUbiquitin and proteasome pathways→Travaux en français237 207→