Abstract 3973: Cancer B cell blueprint reveals dysfunctional extra-follicular dominance with therapeutic opportunity
Notice bibliographique
Résumé
Abstract B cells are essential components of humoral immunity but harbor multifaceted functions across cancers. To decode tumor-infiltrating B cells, we generated the B cell blueprint encompassing single-cell transcriptome, BCR repertoire, and chromatin accessibility data across 20 cancer types (483 samples, 266 patients). Strikingly, B cells harbored extraordinary heterogeneity and composed of 15 subsets, which were grouped into two independent developmental paths (extra-follicular [EF] versus germinal-center [GC]) exhibiting organ preference. Of note, colon adenocarcinoma and hepatocellular carcinoma are the two representative types of cancer enriched for GC and EF pathways, respectively. We affirm that EF-dominant cancers correlate with dysregulated immune responses and worse clinical outcomes. We then identify the dynamic metabolic-epigenetic-signaling networks in fine-tuning tumor-infiltrating B cell differentiation and managing the balance between the EF and GC pathways. Atypical memory (AtM) B cells, the primary progenitors of EF-derived ASCs, exhibit an exhausted and bystander phenotype and develop independently of the GC pathway. We find that the AtM B cells reside in the center of immature TLSs and spatially relocate to the periphery during TLS maturation. Finally, we mechanistically link these findings to specific transcription factors and epigenomic regulations. We demonstrate that the glutamine-derived metabolite α-ketoglutarate (αKG) could increase the expression of AtM B cell associated transcription factors Tbet and BATF and promote their differentiation, accompanied by the activation of mammalian target of rapamycin complex 1 (mTORC1) signaling. Consequently, AtM B cells acquire an immunoregulatory function that dampens anti-tumor T cell responses and fosters an immunosuppressive microenvironment. Citation Format: Jiaqiang Ma, Yingcheng Wu, Lifeng Ma, Xupeng Yang, Tiancheng Zhang, Guoji Guo, Jia Fan, Xiaoming Zhang, Qiang Gao. Cancer B cell blueprint reveals dysfunctional extra-follicular dominance with therapeutic opportunity [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2024; Part 1 (Regular Abstracts); 2024 Apr 5-10; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(6_Suppl):Abstract nr 3973.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».