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Enregistrement W4393095582 · doi:10.1158/1538-7445.am2024-4327

Abstract 4327: Development of bioluminescent biosensors to monitor the interaction betweenGSDMD and caspase-1 in living cells

2024· article· en· W4393095582 sur OpenAlexaff
Tynan Kelly

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquebioluminescence and chemiluminescence research
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBioluminescenceBiosensorMicrobiologyBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Gasdermin D (GSDMD) is the key executioner of pyroptosis, an inflammatory form of programmed cell death implicated in various inflammation-driven diseases, including cancer, heart failure and strokes. The interaction between GSDMD and caspase-1 (CASP1) orchestrates the critical pathway of GSDMD-mediated pyroptosis. During pyroptosis, pyroptosis stimuli activate CASP1, which subsequently binds to and cleave GSDMD between GSDMD’s N- and C-terminal domains. The free N-terminal domains oligomerize and translocate to the cell membrane, forming pores and releasing proinflammatory cytokines and causing cellular lysis. Key interaction sites have been identified for GSDMD recognition and engagement by CASP1; therefore, blocking functionally significant residues presents a new therapeutic strategy for inhibiting CASP1-induced GSDMD cleavage and pyroptosis. Currently, there is no small molecule capable of specifically disrupting the GSDMD and CASP1 interaction. In response, the ongoing pursuit of identifying potential inhibitors is a driving force for developing a biosensor capable of monitoring this interaction and their roles in downstream pyroptotic effects. In this study, we utilized the NanoLuc Binary Technology (NanoBiT) to construct several bioluminescent biosensors comprising two NanoLuc luciferase enzyme fragments (LgBiT and SmBiT) fused to GSDMD and CASP1, respectively, in various combinations. Further validation of these biosensors by luciferase assays in living cells identified a GSDMD-CASP1 biosensor with highest luciferase activity. This newly developed biosensor paves the way for high-throughput screens to identify novel small molecule inhibitors disrupting the GSDMD-CASP1 interplay. These small molecule inhibitors will effectively impede GSDMD-mediated pyroptosis, holding promise for novel therapies of various human diseases. Citation Format: Tynan Kelly. Development of bioluminescent biosensors to monitor the interaction betweenGSDMD and caspase-1 in living cells [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2024; Part 1 (Regular Abstracts); 2024 Apr 5-10; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(6_Suppl):Abstract nr 4327.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,397
Écart entre enseignants0,341 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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