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Enregistrement W4393096615 · doi:10.1111/vox.13617

An international review of the characteristics of viral nucleic acid‐amplification testing (NAT) reveals a trend towards the use of smaller pool sizes and individual donation NAT

2024· article· en· W4393096615 sur OpenAlexaff
Helen M. Faddy, Carla Osiowy, Brian Custer, Michael P. Busch, Susan L. Stramer, Melinda M. Dean, Jessika Acutt, Elvina Viennet, Thijs van de Laar, Wai‐Chiu Tsoi, Claire E. Styles, Phil Kiely, Angelo R. Margaritis, So‐Yong Kwon, Yan Qiu, Xuelian Deng, Antoine Lewin, Signe Winther Jørgensen, Christian Erikstrup, David Juhl, Sílvia Sauleda, Bernardo Camacho, Lisbeth Jennifer Catherine Soto Coral, Paula Andrea Gaviria García, Sineenart Oota, Sheila F. O’Brien, Silvano Wendel, Emma Castro, Heli Harvala, Katy Davison, Claire Reynolds, Lisa Jarvis, Piotr Grabarczyk, Aneta Kopacz, Magdalena Łętowska, Niamh O’Flaherty, Fiona Young, Pádraig Williams, Lisa Burke, Sze Sze Chua, An Muylaert, Isabel Page, Ann Jones, Christoph Niederhauser, Marion Vermeulen, Syria Laperche, Pierre Gallian, Masahiro Satake, Marcelo Addas‐Carvalho, Sebastián Blanco, Sandra Gallego, Axel Seltsam, Marijke Weber‐Schehl, Arwa Z. Al‐Riyami, Khuloud Al Maamari, Fatma Ba Alawi, Hem Chandra Pandey, Rochele Azevedo França, Richard Charlewood

Notice bibliographique

RevueVox Sanguinis · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis B Virus Studies
Établissements canadiensCanadian Blood ServicesHéma-QuébecPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNatVirologyMedicineNucleic acid testHepatitis C virusSerologyVirusImmunologyAntibodyInternal medicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Computer scienceInfectious disease (medical specialty)Disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND OBJECTIVES: Nucleic acid-amplification testing (NAT) is used for screening blood donations/donors for blood-borne viruses. We reviewed global viral NAT characteristics and NAT-yield confirmatory testing used by blood operators. MATERIALS AND METHODS: NAT characteristics and NAT-yield confirmatory testing used during 2019 was surveyed internationally by the International Society of Blood Transfusion Working Party Transfusion-Transmitted Infectious Diseases. Reported characteristics are presented herein. RESULTS: NAT was mainly performed under government mandate. Human immunodeficiency virus (HIV), hepatitis C virus (HCV) and hepatitis B virus (HBV) NAT was performed on all donors and donation types, while selective testing was reported for West Nile virus, hepatitis E virus (HEV), and Zika virus. Individual donation NAT was used for HIV, HCV and HBV by ~50% of responders, while HEV was screened in mini-pools by 83% of responders performing HEV NAT. Confirmatory testing for NAT-yield samples was generally performed by NAT on a sample from the same donation or by NAT and serology on samples from the same donation and a follow-up sample. CONCLUSION: In the last decade, there has been a trend towards use of smaller pool sizes or individual donation NAT. We captured characteristics of NAT internationally in 2019 and provide insights into confirmatory testing approaches used for NAT-yields, potentially benefitting blood operators seeking to implement NAT.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,019
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,056

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,019
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0070,007
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,120
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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