Abstract 6333: A high-parameter mass cytometry panel for the functional characterization of CAR T cells
Notice bibliographique
Résumé
Abstract High-parameter flow cytometry provides a powerful tool for in-depth analysis of CAR T cell therapy, from characterizing CAR T cell populations to understanding their interactions within the tumor microenvironment. This information is crucial for advancing CAR T cell therapies and improving their effectiveness in treating cancer. To address the need for deep immunoprofiling at all stages of CAR T cell therapy, we created a robust and comprehensive mass cytometry panel of antibodies against 44 cell surface and intracellular markers. This assay allows for comprehensive characterization of CAR T cell features including surface marker expression, activation state, cytokine production, and differentiation status. These data will provide researchers with a better understanding of the phenotype of the CAR T cells used in therapy and can guide optimization efforts to enhance expansion, persistence, and self-renewal. For example, newer-generation CAR T cells (T cells redirected for antigen-unrestricted cytokine-initiated killing, or TRUCKs) that are engineered to produce cytokines such as IL-2 to enhance their own survival can be evaluated in vitro to select CAR constructs with the most potent anti-tumor activity. The lyophilized and validated 30-marker Maxpar® Direct™ Immune Profiling Assay™ enables comprehensive characterization of immune cell populations in both whole blood and PBMC. The 7-marker Maxpar Direct T Cell Expansion Panel 3 (OX40, TIGIT, CD69, PD-1, Tim-3, ICOS, and 4-1BB) and the Maxpar Direct Basic Activation Expansion Panel (CD107a, IL-2, TNFα, IFNγ, perforin, and granzyme B) are add-on modules that can further characterize CAR T cell exhaustion, degranulation, cytokine production, and cytotoxicity against target cells. We also compared CAR T detection options for sensitivity and specificity using a CD19 CAR-transduced cell line spiked into healthy donor PBMC. Indirect staining with Miltenyi Biotec biotinylated CD19 CAR Detection Reagent followed by anti-biotin- or streptavidin-conjugated metal tags was compared against a directly conjugated or biotinylated anti-G4S linker antibody. We included sample multiplexing using 6 metal-tagged CD45 antibodies to address the need to minimize batch effects, crucial to multi-site and longitudinal studies. Samples were acquired on a CyTOF® XT™ instrument, and preliminary data analysis was performed using Maxpar Pathsetter™ for automated enumeration of immune cells. By combining the lyophilized single-tube Maxpar Immune Profiling Assay and Expansion Panels with specific detection of CAR T cells, this assay enables researchers to analyze multiple key parameters simultaneously at the single-cell level at all stages of CAR T therapy development. For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. Citation Format: Deeqa Mahamed, Geneve Awong, Thiru Selvanatham. A high-parameter mass cytometry panel for the functional characterization of CAR T cells [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2024; Part 1 (Regular Abstracts); 2024 Apr 5-10; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(6_Suppl):Abstract nr 6333.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,018 | 0,010 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».