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Enregistrement W4393138821 · doi:10.1016/j.jbc.2024.106925

Abstract 1570 Design and Expression of an Ankyrin-like Molecular Probe for α-Neurexin 1 Labelling in Live Neurons

2024· article· en· W4393138821 sur OpenAlexafffundabout
Vicente Stranger Mackinnon, Fréderic Ménard

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiotin and Related Studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésLabellingAnkyrinAnkyrin repeatCell biologyExpression (computer science)ChemistryBiophysicsBiologyMolecular biologyBiochemistryComputer scienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neurexins (NRXNs) are a set of polymorphic cell adhesion molecules that play a key role in formation of new synaptic connections and pre-synaptic differentiation. Multiple binding partners for both α- and β- neurexins help shape the synaptic terminal and stablish stable connections between neurons. Additionally, NRXNs participate in remodelling of synapses terminal and the establishment of new connections. Impairment of proper neurexin function has been related to several psychological, developmental disorders and have been proposed to play a role in neurodegenerative pathogenesis in Alzheimer's disease alongside their post-synaptic counterpart neuroligin 1 (NLGN1). However, we lack the tools to study molecular mechanisms involving neurexins impairments in live cells without undergoing genetic engineering or heterologous gene expression. Herein we describe the development of a selective molecular probe for a-NRXN 1 to allow the real-time tracking of the receptor in live neurons. To achieve this, we used α-latrotoxin (α-LTX), a neurotoxin from the Latrodectus genus. Docking simulations were carried out to determine the binding domain to α-NRXN. We generated a bacterial recombinant expression vector to produce an ankyrin-like fragment of α-LTX. This α-LTX fragment was then used in transfected HEK 293 cells with α-NRXN 1 to measure binding selectivity and cytotoxicity. The final molecular probe offers a new approach for neurexin labelling in live cells to track its dynamic re-organization at synaptic termini during synaptic plasticity. This research was supported in part by the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC 2020-06103) and the University of British Columbia. We gratefully thank UBC Okanagan College of Graduate Studies for active support and research scholarships.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,346

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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