MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4393139342 · doi:10.1016/j.jbc.2024.106038

Abstract 2225 Assessing Compound Efficacy in Huntington's Disease Pathology using pEGFP-Q74 Transfected HeLa Cells

2024· article· en· W4393139342 sur OpenAlexfundno aff
Jillian Berko, S.A. Krueger

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésHeLaTransfectionHuntington's diseaseMolecular biologyDiseaseCellBiologyCancer researchCell culturePathologyMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Huntington's disease (HD) is a rare neurodegenerative disease impacting approximately 2.7 individuals out of 100,000 worldwide. However, it presents an appealing focus for nucleic acid-targeting therapies. This is due to its origin in an expanded DNA repeat, which, when transcribed, produces harmful repeat RNA. Thus, we hypothesized that a compound that binds to the disease-causing DNA and inhibits transcription to prevent the formation of toxic RNA could be promising as a HD therapeutic. By preventing the formation of toxic RNA, the downstream translation that forms homopolymeric proteins could be knocked down, potentially diminishing protein aggregates that often cause HD symptoms and disease progression. This investigation focuses on a specific compound functioning as a groove binder. In this study we tested the compound of interest in Hela Cells transfected with the pEGFP-Q74 plasmid. A fluorescence microscope was used to determine if the amount of protein aggregates increased or decreased in the presence of our compound in a normal length repeat as compared to the disease length. Thus, this work contributes to understanding the efficacy of this compound as a treatment for HD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological Chemistry→Même sujetGenetic Neurodegenerative Diseases→Travaux en français237 207→